基于高通量测序技术对染色体外环状DNA研究的最新进展 |
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引用本文: | 郭志涛,武慧慧,耿淑慧,陈晨,孟祥宁,孙文靖,朱静.基于高通量测序技术对染色体外环状DNA研究的最新进展[J].生命科学,2023(6):824-832. |
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作者姓名: | 郭志涛 武慧慧 耿淑慧 陈晨 孟祥宁 孙文靖 朱静 |
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作者单位: | 1. 哈尔滨医科大学医学遗传学研究室;2. 中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) |
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基金项目: | 2019年度黑龙江省自然科学基金-优秀青年基金(YQ2019H002);;2018年黑龙江省留学回国人员择优资助项目(启动类); |
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摘 要: | 染色体外环状DNA (extrachromosomal circular DNA, eccDNA)是一种真核生物染色体外的闭合环状DNA结构,长度和染色体起源具有较高异质性。ecc DNA这一名称目前主要指大小在数百kb以内的小分子染色体外环状DNA,包括micro DNA、小多分散环状DNA (small polydispersed circular DNA, spcDNA)以及其他未分类的小分子eccDNA等。高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)是一种可以同时对百万条DNA分子进行序列测定的技术,又名新一代测序技术(next generation sequencing, NGS),具有高通量、高灵敏度、高准确度等优势。近年来高通量测序结合生物信息学分析技术不仅在揭示eccDNA染色体起源、分子结构、发生机制和潜在功能以及循环系统中的eccDNA分子特征研究等方面发挥了重要作用,而且推动了eccDNA在甲基化等表观遗传学方面的研究。生物信息学软件的发展和eccDNA分析算法的开发也对其研究提供了重要帮助。血浆以及尿液等液体活检常用体液样本中...
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关 键 词: | 染色体外环状DNA microDNA 高通量测序技术 液体活检 |
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