| 鸟王茶基因密码子偏好性分析 |
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| 引用本文： | 滕腾,赵懿琛,赵德刚.鸟王茶基因密码子偏好性分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(2):795-801. |
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| 作者姓名： | 滕腾 赵懿琛 赵德刚 |
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| 作者单位： | 贵州大学茶学院,山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵阳,550025;贵州大学茶学院,山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵阳,550025;贵州省农业科学院,贵阳,550006 |
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| 摘 要： | 生物体中普遍存在密码子使用偏好性,这对基因的异源表达效率具有较大影响.本研究使用CodonW软件对鸟王茶(Camellia sinensis var.niaowangensis)转录本中1 856个编码氨基酸的基因密码子进行分析,计算其密码子相对使用度,确定了27个最优密码子,并发现最优密码子大多以A或U结尾.通过ENC-GC3关联分析及PR2-plot偏倚分析,发现鸟王茶密码子使用模式受到突变和选择等多种因素的影响.与其他物种对比发现,鸟王茶密码子偏好性与其他物种存在不同程度的差异,其中与杨树及烟草差异最小.由于密码子具有通用性,分析结果对通过重建密码子提高茶树基因在其他植物中的表达效率从而验证鸟王茶基因功能具有一定意义.
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| 关 键 词： | 鸟王茶 密码子用法 高频密码子 密码子偏好性 |
Analysis of Genetic Codon Preference of Camellia sinensis var.niaowangensis |
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| Teng Teng,Zhao Yichen,Zhao Degang.Analysis of Genetic Codon Preference of Camellia sinensis var.niaowangensis[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(2):795-801. |
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| Authors: | Teng Teng Zhao Yichen Zhao Degang |
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