| 芝麻MATE基因家族的全基因组鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 梁俊超,孙建,颜廷献,乐美旺,饶月亮,颜小文,周红英.芝麻MATE基因家族的全基因组鉴定与表达分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(2):735-746. |
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| 作者姓名： | 梁俊超 孙建 颜廷献 乐美旺 饶月亮 颜小文 周红英 |
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| 作者单位： | 江西省农业科学院作物研究所,国家油料改良中心南昌分中心,江西省油料作物生物学重点实验室,南昌,330200 |
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| 摘 要： | 植物为了维持其生命系统的正常运转,需要对各种代谢产物和毒素进行转运和排出.多药与毒性化合物排出转运蛋白(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)在多种底物和毒素的运输中起到重要作用.本研究利用生物信息学手段对芝麻MATE基因家族进行了全基因组分析,鉴定得到67个MATE基因,分布于全部13条染色体上,亚细胞定位预测表明这些基因主要位于质膜上.串联复制和全基因组复制是芝麻MATE基因家族扩增的主要动力.比较基因组学分析发现在芝麻和拟南芥中具有许多共线性的MATE基因,且大部分串联复制SiMATE基因产生于芝麻和拟南芥分化之后.系统进化分析可将芝麻MATE成员分为4个亚家族,大部分相似功能的己知植物MATE成员被聚在同一分枝中,进化树中关系较近的芝麻MATE成员往往具有相似的基因结构和保守基序.基因表达分析表明一半以上的SiMATE基因具有组织表达特异性.这些结果为芝麻MATE基因功能的研究提供了重要参考.
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| 关 键 词： | 芝麻 MATE基因家族 系统进化分析 保守基序 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of MATE Gene Family in Sesame |
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| Liang Junchao,Sun Jian,Yan Tingxian,Le Meiwang,Rao Yueliang,Yan Xiaowen,Zhou Hongying.Genome-wide Identification and Expression Analysis of MATE Gene Family in Sesame[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(2):735-746. |
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| Authors: | Liang Junchao Sun Jian Yan Tingxian Le Meiwang Rao Yueliang Yan Xiaowen Zhou Hongying |
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