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大熊猫核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)cDNA的克隆及序列分析
引用本文:孙冰,侯怡铃,李俊,苏秀兰,吴光富,宋嫣,张田,侯万儒.大熊猫核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)cDNA的克隆及序列分析[J].四川动物,2010,29(5).
作者姓名:孙冰  侯怡铃  李俊  苏秀兰  吴光富  宋嫣  张田  侯万儒
作者单位:西华师范大学生命科学学院,四川南充,637002
基金项目:国家自然科学基金资助项目,四川省应用技术资助项目,四川省教育厅重点科研项目,四川省重点学科动物学建设经费资助,四川省应用基础项目,四川省教育厅青年基金项目 
摘    要:RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,由RPS11基因所编码,属于核糖体蛋白S17p家族,主要存在于真核生物中.为了解大熊猫核糖体蛋白亚基RPS11基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS11 基因的异同,本研究根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)的相关信息设计引物,运用RT-PCR 技术从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基RPS11基因,并进行了测序和序列分析.结果表明:大熊猫RPS11亚基基因的开放阅读框(ORF)长为477 bp,编码158 个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子量为18.4275 kDa,pI为10.96.拓扑预测显示该蛋白含有14个功能位点:即2 个N-糖基化位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个核糖体蛋白S17 signature位点.进一步分析发现,大熊猫RPS11基因与已报道的部分哺乳动物的表达序列及其编码的氨基酸序列都具有很高的相似性.本研究结果为丰富和完善哺乳动物RPS11基因资源库提供了基础资料.

关 键 词:大熊猫  克隆  序列分析

cDNA Cloning and Sequence Analysis of the Ribosomal Protein S11 Gene (RPS11)from the Giant Panda
SUN Bing,HOU Yi-ling,LI Jun,SU Xiu-lan,WU Guang-fu,SONG Yan,ZHANG Tian,HOU Wan-ru.cDNA Cloning and Sequence Analysis of the Ribosomal Protein S11 Gene (RPS11)from the Giant Panda[J].Sichuan Journal of Zoology,2010,29(5).
Authors:SUN Bing  HOU Yi-ling  LI Jun  SU Xiu-lan  WU Guang-fu  SONG Yan  ZHANG Tian  HOU Wan-ru
Abstract:
Keywords:RT-PCR  RPS11
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