| 用于高通量测序未知病原体分析的样本预处理方法及扩增方案概述 |
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| 引用本文： | 安小平,童贻刚.用于高通量测序未知病原体分析的样本预处理方法及扩增方案概述[J].生物技术通讯,2015(2):286-290. |
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| 作者姓名： | 安小平 童贻刚 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(2012AA022003,2014AA021402);“十二五”国家科技重大专项(2013ZX10004605,2011ZX10004001,2013ZX10004607-004,2013ZX10004217-002-003);病原微生物生物安全国家重点实验室开放课题(SKLPBS1113) |
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| 摘 要： | 2005年以来,二代测序平台和测序技术越来越普及,被广泛用于新病毒和未知病原体的发现,从未经培养的复杂样本中筛查病毒类病原体需要更多的前期处理措施。我们围绕高通量测序所涉及到的测序样本预处理方法和扩增方法做简要总结:样品类型分为无菌样本和开放样本;病原体类型包括病毒、细菌、真菌等;背景核酸去除的常用方法包括物理分离、核酸酶消化和几种r RNA去除的方法;常用的微量样本非特异性扩增方法包括随机引物PCR、SISPA技术、锚定随机引物PCR、RCA技术、MDA技术和NASBA技术。
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| 关 键 词： | 高通量测序 病原体 样本预处理 背景核酸去除 非特异性扩增 |
Overview of the Pretreatment Methods and the Amplification Meth-ods Screening for Unknown Pathogen by High-Throughput Sequencing |
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| AN Xiao-Ping;TONG Yi-Gang.Overview of the Pretreatment Methods and the Amplification Meth-ods Screening for Unknown Pathogen by High-Throughput Sequencing[J].Letters in Biotechnology,2015(2):286-290. |
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| Authors: | AN Xiao-Ping;TONG Yi-Gang |
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| Institution: | AN Xiao-Ping;TONG Yi-Gang;Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology; |
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