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基于RNA-seq分析bdhA敲除对枯草芽孢杆菌产纳豆激酶和MK-7的影响
引用本文:黄茜琳,黄俊宝,高旭丽,罗雅妮,陶伟,郭明雨,刘永圆,吴晶,吴超,薛正莲,陈宇,刘艳. 基于RNA-seq分析bdhA敲除对枯草芽孢杆菌产纳豆激酶和MK-7的影响[J]. 微生物学报, 2024, 64(7): 2394-2406
作者姓名:黄茜琳  黄俊宝  高旭丽  罗雅妮  陶伟  郭明雨  刘永圆  吴晶  吴超  薛正莲  陈宇  刘艳
作者单位:安徽工程大学生物与食品工程学院, 安徽 芜湖 241000;安徽工程大学生物与食品工程学院, 安徽 芜湖 241000;安徽省工业微生物分子育种工程实验室, 安徽 芜湖 241000
基金项目:国家自然科学基金(32372295);安徽省高校杰出青年科研项目(2023AH020013);安徽省大学生创新创业计划(202310363254)
摘    要:纳豆激酶(nattokinase, NK)具有多种生理功能,是治疗心血管疾病的理想药物。甲萘醌-7 (menaquinone-7, MK-7)是人体不可缺少的脂溶性维生素之一,可预防骨质疏松和帕金森等疾病。【目的】提高枯草芽孢杆菌中NK和MK-7共同生产的产量,揭示重组菌中共同生产NK和MK-7的机理,为MK-7和NK的生成提供新的代谢工程策略。【方法】以枯草芽孢杆菌为出发菌株,敲除2,3-丁二醇脱氢酶基因(bdhA),构建一株能增加NK和MK-7共同生产的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) 168-ΔbdhA。利用RNA-seq分析NK和MK-7合成途径关键酶编码基因的变化,总结NK和MK-7共同生产的机制。【结果】与原始菌株相比,Bacillus subtilis 168-ΔbdhA中2,3-丁二醇含量降低64.0%,为2.76 g/L。NK和MK-7的产量较原始菌株提高30.0%和60.0%。RNA-seq分析表明,中心碳代谢、氧化磷酸化和NK及MK-7合成等过程相关的基因表达存在差异。NK负调控因子codY下调2.19倍。在蛋白质分泌途径中,secA下调0.37倍,tatADtatC分别上调2.81倍和0.50倍。【结论】bdhA的敲除阻断了2,3-丁二醇的碳通量,促进甘油的吸收,碳通量更多地流向NK和MK-7的合成途径。负调控因子codY的下调促进NK转录,蛋白转运相关途径基因的上下调促进MK-7的胞外分泌,从而实现其产量的增加。

关 键 词:枯草芽孢杆菌  纳豆激酶  甲萘醌-7  2,3-丁二醇脱氢酶  RNA-seq
收稿时间:2023-12-13
修稿时间:2024-03-18

RNA-seq reveals the effects of bdhA knockout on co-production of nattokinase and menaquinone-7 by Bacillus subtilis
HUANG Xilin,HUANG Junbao,GAO Xuli,LUO Yani,TAO Wei,GUO Mingyu,LIU Yongyuan,WU Jing,WU Chao,XUE Zhenglian,CHEN Yu,LIU Yan. RNA-seq reveals the effects of bdhA knockout on co-production of nattokinase and menaquinone-7 by Bacillus subtilis[J]. Acta microbiologica Sinica, 2024, 64(7): 2394-2406
Authors:HUANG Xilin  HUANG Junbao  GAO Xuli  LUO Yani  TAO Wei  GUO Mingyu  LIU Yongyuan  WU Jing  WU Chao  XUE Zhenglian  CHEN Yu  LIU Yan
Affiliation:College of Biology and Food Engineering, Anhui Polytechnic University, Wuhu 241000, Anhui, China;College of Biology and Food Engineering, Anhui Polytechnic University, Wuhu 241000, Anhui, China;Anhui Engineering Laboratory for Industrial Microbiology Molecular Breeding, Wuhu 241000, Anhui, China
Abstract:
Keywords:Bacillus subtilis  nattokinase  menaquinone-7  2,3-butanediol dehydrogenase  RNA-seq
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