韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析 |
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引用本文: | 韦传宝,,华俊雅,杨宇,隗洋洋,史利利.韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析[J].广西植物,2012,32(2):231-237. |
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作者姓名: | 韦传宝 华俊雅 杨宇 隗洋洋 史利利 |
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作者单位: | 韦传宝 (皖西学院,生物与制药工程学院,安徽,六安,237012) ; 华俊雅 (安徽省植物生物技术实训中心,安徽,六安,237012) ; 杨宇 (皖西学院,生物与制药工程学院,安徽,六安,237012) ; 隗洋洋 (皖西学院,生物与制药工程学院,安徽,六安,237012) ; 史利利 (皖西学院,生物与制药工程学院,安徽,六安,237012) ; |
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基金项目: | 安徽省教育厅自然科学基金重点项目 |
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摘 要: | 设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系。结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%~84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%~90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%~94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小。进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远。
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关 键 词: | 韭葱黄条病毒 洋葱黄矮病毒 胡葱黄条病毒 CP基因 序列分析 |
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