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芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析北大核心CSCD
引用本文:曾东琳,唐为玲,曾家晶,Gefu WANG PRUSKI,赖钟雄,郭容芳. 芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析北大核心CSCD[J]. 西北植物学报, 2022, 42(3): 361-370
作者姓名:曾东琳  唐为玲  曾家晶  Gefu WANG PRUSKI  赖钟雄  郭容芳
作者单位:(1 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州 350002;2 福建农林大学戴尔豪西大学联合实验室,福州 350002)
基金项目:国家自然科学基金(31772310,31401859);
摘    要:SPL存在于所有绿色植物中,在植物生长发育及叶片形成中起着重要的作用。该研究以‘改良香菇’芥蓝为材料,采用生物信息学方法,对芥蓝SPL家族(BoSPL)进行全基因组鉴定及分析;采用PCR技术克隆BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并对芥蓝不同生长时期及不同组织部位进行定量分析,为揭示‘改良香菇’芥蓝叶片发育过程的分子机制以及培育芥蓝新品种奠定基础。结果表明:(1)BoSPL家族共有31个成员,编码区蛋白质氨基酸长度在157~1028 aa之间,BoSPL蛋白质的氨基酸均没有信号肽,属于非分泌蛋白;亚细胞定位预测结果显示,所有的BoSPL家族成员均有定位在细胞核上,少数成员有定位在液泡、叶绿体和细胞质中;BoSPL家族基因包含内含子数量为1~9个,所有成员均包含SBP保守结构域;系统进化分析显示,BoSPL可以分为8个进化群亚组,各群基因数量不等,且BoSPL进化关系与AtSPL相似。(2)成功克隆到BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并成功构建pCAMBIA1302-35S-BoSPL3-1-GFP、pCAMBIA1302-35S-BoSPL10-2-GFP和pCAMBIA1302-35S-BoSPL11-2-GFP重组质粒,经根癌农杆菌GV3101介导瞬时转化烟草下表皮细胞,激光共聚焦显微镜检测表明,BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2均定位在细胞核中,与预测结果一致。(3)qRT-PCR分析显示,BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2在‘改良香菇’芥蓝叶片中相对表达量均较高,但3个基因在叶肉中的相对表达量无明显差异,而BoSPL10-2在花状变形叶中却显著高表达,推测其可能与花状变形叶形成相关。

关 键 词:芥蓝  BoSPL  全基因组鉴定  亚细胞定位

Identification and Expression Analysis of SPL Gene Family in Chinese Kale
ZENG Donglin,TANG Weiling,ZENG Jiajing,Gefu WANG-PRUSKI,LAI Zhongxiong,GUO Rongfang. Identification and Expression Analysis of SPL Gene Family in Chinese Kale[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2022, 42(3): 361-370
Authors:ZENG Donglin  TANG Weiling  ZENG Jiajing  Gefu WANG-PRUSKI  LAI Zhongxiong  GUO Rongfang
Abstract:
Keywords:Chinese kale   SPL   whole genome identification   subcellular localization
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