基于比较基因组学的解脂亚罗酵母CA20高产赤藓糖醇机理及进化分析

解脂亚罗酵母(Yarrowia lipolytica)是赤藓糖醇生产中使用的主要菌种，复合诱变是选育优良菌株的常用方法。然而，诱变处理所引起的基因组变化尚待探索。本研究对前期获得的高产菌株CA20和原始菌株WT5进行基因组测序，并与已发布的8株解脂亚罗酵母进行比较基因组分析，旨在探究菌株CA20高产赤藓糖醇的机理以及不同菌株的基因组进化关系。结果显示，菌株CA20基因组大小为20,420,510 bp,GC碱基含量为48.97%，编码6330个CDS和649个ncRNA，菌株CA20和其他8株菌高度同源，平均核苷酸同源性(average nucleotide identity,ANI)> 99.50%，其中与菌株IBT 446和H222具有更近的亲缘关系。比较基因组分析显示，CA20和其他8株菌共有5342个核心基因，而CA20特有的65个基因主要参与物质跨膜运输和蛋白质转运过程。CA20基因组中含有166个碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)基因，远多于其他菌株(108～137个)，包括特有的4个糖苷水解酶类(glycosi...