| 黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 柯杨,黄原,雷富民.黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析[J].遗传,2010,32(9). |
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| 作者姓名： | 柯杨 黄原 雷富民 |
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| 作者单位： | 1. 陕西师范大学生命科学学院,西安,710062
2. 中国科学院动物研究所动物系统与进化重点实验室,北京,100101 |
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| 基金项目： | 国家杰出青年科学基金项目，中国科学院动物进化与系统学重点实验室开放课题 |
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| 摘 要： | 采用长PCR扩增的线粒体DNA和引物步移法,测定并注释了中国特有鸟类-黑尾地鸦(Podoces hend-ersoni)的线粒体基因组全序列。黑尾地鸦的mtDNA序列全长16867bp,GenBank登录号GU592504。基因含量和排列次序与原鸡的一致,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和1个控制区(D-loop)。除COI基因以GTG作为起始密码子外,其余12个蛋白质编码基因均以典型ATG密码子起始。11个蛋白编码基因以完全终止密码子TAA、AGG或AGA终止,COIII和ND4基因终止密码子为不完整的T。tRNASer(AGY)的DHU臂缺失,tRNALeu(CUN)的反密码子环由9个碱基构成,而不是标准的7个碱基。其余的20个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。预测了rRNA的二级结构,其中,12S rRNA二级结构包含4个结构域,43个茎环结构;16S rRNA的二级结构包含6个结构域,55个茎环结构。此外,在其他鸟类控制区中所发现的F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box也同样存在于黑尾地鸦中。
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| 关 键 词： | 黑尾地鸦 线粒体基因组 rRNA二级结构 控制区 |
Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Podoces hendersoni (Ave, Corvidae) |
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| KE Yang,HUANG Yuan,LEI Fu-Min.Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Podoces hendersoni (Ave, Corvidae)[J].Hereditas,2010,32(9). |
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| Authors: | KE Yang HUANG Yuan LEI Fu-Min |
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