| 马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征 |
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| 引用本文： | 史凤阳,高芳銮,沈建国,常飞,詹家绥.马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征[J].遗传,2014,36(7):713-722. |
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| 作者姓名： | 史凤阳 高芳銮 沈建国 常飞 詹家绥 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学植物病毒研究所, 福建省植物病毒学重点实验室, 福州 350002; 2. 福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心, 福州 350001 |
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| 基金项目： | 国家现代农业马铃薯产业技术体系(编号:CARS-10);福建省自然科学基金项目(编号:2013J01088);福建省教育厅科技项目(编号:JA12119);国家质检总局科技计划项目(编号:2013IK299,2013IK094);福建出入境检验检疫局科技项目(编号:FK2011-07,FK2007-07)资助 |
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| 摘 要： | 为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)P1基因的分子变异及结构特征, 并查明福建分离物P1基因的变异来源。文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列, 分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征, 并采用贝叶斯法重建P1基因的系统发育树。结果显示, 12个福建分离物均成功扩增出预期大小(约915 bp)的特异性片段, P1基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核苷酸序列一致性为73%~99%; QK44、XT02、XT08、LH05分离物的309 nt位置均检测到一个强烈的重组信号。12个PVY分离物中, P1蛋白有85个变异的氨基酸位点, 表明其高度变异; P1蛋白的第41~275位是一个高度保守的结构功能域, 含有3个保守的活性位点(H192、D201、V235); 系统发育分析显示, 福建分离物形聚为3种不同的簇, 其对应的卷曲结构(Coiled-coil domain)和空间结构也不相同, 表明不同株系型的P1基因在系统发育关系上分化较大。该研究结果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性, 但行使P1蛋白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守; 福建分离物P1基因的变异源主要来自碱基突变和基因重组。
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| 关 键 词： | 马铃薯Y病毒 基因 变异 重组 |
| 收稿时间： | 2014-03-20 |
Sequence variation of P1 gene in Potato virus Y isolated from Fujian Province |
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| Institution: | 1. Key Laboratory of Plant Virology of Fujian Province, Institute of Plant Virology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China; 2. Inspection & Quarantine Technology Center, Fujian Exit-Entry Inspection and Quarantine Bureau, Fuzhou 350001, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Potato virus Y P1 gene variation recombination |
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