目标?鄄诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展 |
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作者姓名: | 冯晓东 马洁 常乘 白明泽 朱云平 舒坤贤 |
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作者单位: | 重庆邮电大学生物信息学研究所,重庆 400065;军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京 102206,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京 102206,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京 102206,重庆邮电大学生物信息学研究所,重庆 400065,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京 102206,重庆邮电大学生物信息学研究所,重庆 400065 |
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基金项目: | 国际合作计划(2014DFB30010)、国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB910800), 国家自然科学基金(21475150, 21105121, 61501071)资助项目和重庆市研究生科研创新项目(CYS14154)资助 |
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摘 要: | 基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的质量控制尤为重要,而基于目标-诱饵库(target-decoy)搜索策略的质量控制是目前应用最为广泛的方法.本文首先介绍了基于目标-诱饵库搜索策略搜库和质量控制的实施流程,然后综述了基于目标-诱饵库搜索策略的质量控制工具,并提出了目标-诱饵库搜索策略的不足及改善方法,最后对目标-诱饵库搜索策略进行了总结与展望.
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关 键 词: | 串联质谱 蛋白质鉴定 目标-诱饵 质量控制 |
收稿时间: | 2016-03-01 |
修稿时间: | 2016-04-27 |
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