| 葡萄CHS和STS基因家族生物信息学鉴定和表达分析 |
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| 引用本文： | 袁华招,赵密珍,吴伟民,于红梅,王庆莲.葡萄CHS和STS基因家族生物信息学鉴定和表达分析[J].植物遗传资源学报,2016,17(4):756-765. |
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| 作者姓名： | 袁华招 赵密珍 吴伟民 于红梅 王庆莲 |
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| 作者单位： | 江苏省农业科学院园艺研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,南京,210014 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金项目(编号: BK20131331)和现代农业产业技术体系专项基金项目（编号: CARS-3O） |
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| 摘 要： | 查尔酮合成酶(CHS,chalcone synthase)是植物体类黄酮类化合物合成的第1个关键酶和限速酶,它能够催化丙二酰-Co A和对香豆酸-Co A合成柚皮素查尔酮。二苯乙烯合成酶(STS,stilbene synthase)是芪类化合物合成路径的关键酶,与查尔酮合成酶有共同的作用底物,二者具有很高的相似度。为更好地了解葡萄中CHS和STS基因的种类和数量,本研究采用生物信息学方法检索获得葡萄(Vitis vinifera L.)基因组数据库中的CHS和STS基因,通过分析其染色体定位、系统进化和保守基序,发现葡萄基因组可能含有33个STS基因,9个CHS基因,这些基因集中分布在6条葡萄染色体上,部分家族基因在染色体上形成基因簇。葡萄CHS和STS基因家族蛋白长度、基因结构和蛋白基序非常保守,具有很近的进化关系。葡萄芯片数据结果表明,葡萄CHS和STS基因在葡萄果实不同发育时期的果皮和果肉中均有表达,尤其葡萄CHS GroupsⅢ亚家族基因在葡萄果皮中大量表达。葡萄STS基因家族在果实中的表达量较低,部分探针在葡萄果实成熟期的果皮中表达量急剧增加。本研究结果可为葡萄CHS和STS基因在果实发育过程中的功能研究提供参考。
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| 关 键 词： | 葡萄 CHS STS 果实发育 |
| 收稿时间： | 2015/8/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/1/25 0:00:00 |
Genome-wide identification and expression analysis of CHS and STS gene families in grape |
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| YUAN Hua-zhao;ZHAO Mi-zhen;WU Wei-min;YU Hong-mei;WANG Qing-lian.Genome-wide identification and expression analysis of CHS and STS gene families in grape[J].Journal of Plant Genetic Resources,2016,17(4):756-765. |
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| Authors: | YUAN Hua-zhao;ZHAO Mi-zhen;WU Wei-min;YU Hong-mei;WANG Qing-lian |
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| Institution: | Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,,,, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Grape CHS STS Fruit development |
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