首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

复杂的正选择压力驱动不同细胞嗜性HIV-1的进化
作者姓名:张驰宇  丁娜  陈克平  杨荣阁
作者单位:江苏大学生命科学研究院;中国科学院武汉病毒研究所病毒学国家重点实验室;
基金项目:国家自然科学基金(批准号:30600352); 国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB504200); 病毒学国家重点实验室开放基金(批准号:2009008); 江苏大学“拔尖人才培养工程”资助项目
摘    要:对HIV-1细胞嗜性的研究是理解HIV-1传播和发病机制的关键.通过对HIV-1B和C亚型的R5和X4型病毒的全基因组进行适应性进化分析,发现R5和X4病毒经历了不同的进化方式,并且不同的HIV-1基因受到不同的正选择压力,意味着复杂的自然选择压力驱动HIV-1的进化.分析HIV-1Gp120超变区上的正选择位点,发现相对于其他超变区,更多的正选择位点发生在B亚型X4病毒的V3区,B亚型R5病毒的V2区以及C亚型X4病毒的V1和V4区域.因为这些区域通常影响和决定HIV-1的细胞嗜性,更多的正选择发生在这些特定的超变区意味着作用于Gp120上的选择压力与Gp120的受体识别和结合功能有关.值得注意的是,无论是B和C亚型还是R5和X4型病毒,显著更多的正选择位点发生在Gp120的C3区域(33.3%~55.6%,P〈0.05),意味着C3区对HIV-1的生存和适应比先前认识的更为重要.另外,在R5和X4病毒的env基因中,约有一半的正选择位点是相同的,尤其是Gp41上的第96,113和281位正选择位点均出现在所分析的4种病毒类型中.这些共同的正选择位点不仅意味着对病毒生存和适应的重要性,也意味着R5和X4存在交叉免疫源性位点的可能性,这对于AIDS疫苗的发展具有重要意义.

关 键 词:HIV-1细胞嗜性  适应性进化  正选择位点  R5和X4  Gp120  抗原表位
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号