| 葡萄糖诱导绿色杜氏藻转录组及相关通路差异分析 |
| |
| 引用本文： | 朱帅旗 龚一富 刘浩 章丽 王何瑜. 葡萄糖诱导绿色杜氏藻转录组及相关通路差异分析[J]. 中国生物化学与分子生物学报, 2015, 31(8): 857-865. DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.20150812 |
| |
| 作者姓名： | 朱帅旗 龚一富 刘浩 章丽 王何瑜 |
| |
| 作者单位： | (宁波大学海洋学院, 浙江 宁波315211) |
| |
| 基金项目： | 浙江省科技厅重点科技创新团队项目（No.2012R10029-07，No.2010R50029）和宁波市科技攻关项目（No.2013C10018） |
| |
| 摘 要： | 绿色杜氏藻是研究耐盐机理的模式绿藻．葡萄糖不仅是营养物质，而且还是信号物质．目前，对绿色杜氏藻转录组、糖处理后差异表达基因和β-胡萝卜素生物合成途径关键基因表达还不清楚．本研究通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序,获得葡萄糖处理和未处理绿色杜氏藻转录组信息．利用P value值和差异倍数对样本进行差异表达分析，共111条转录本存在差异表达，3条为上调转录本，108条为下调转录本．利用RT-qPCR检验差异表达分析的准确性. 结果表明，转录本表达结果与转录组分析结果一致．GO功能富集结果表明，71条下调转录本与代谢相关,占所有下调转录本的65.74%．KEGG富集分析结果表明，21条KEGG通路含89条下调转录本，14条通路与代谢相关．代谢中通路最多的为能量代谢（6条），含63条下调转录本．能量代谢中与光合作用相关的下调转录本最多，为29条．通过分析找到2条与β-胡萝卜素生物合成相关通路（MVA/MEP途径及β-胡萝卜素合成途径），并发现通路的关键基因hmgs、dxs、dxr、psy、pds、chyb，对其进行差异表达分析，均不存在差异表达．研究表明,葡萄糖抑制了绿色杜氏藻光合作用，代谢受阻，但未影响β-胡萝卜素生物合成相关通路及关键基因．
|
| 关 键 词： | 葡萄糖 绿色杜氏藻 转录组 差异表达 β-胡萝卜素 |
| 收稿时间： | 2015-01-22 |
Analysis of the Dunaliella viridis Transcriptome and Related Pathways following Glucose Induction |
| |
| ZHU Shuai-Qi GONG Yi-Fu LIU Hao ZHANG Li WANG He-Yu. Analysis of the Dunaliella viridis Transcriptome and Related Pathways following Glucose Induction[J]. Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 2015, 31(8): 857-865. DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.20150812 |
| |
| Authors: | ZHU Shuai-Qi GONG Yi-Fu LIU Hao ZHANG Li WANG He-Yu |
| |
| Affiliation: | （School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, Zhejiang, China） |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》下载全文 |
