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基因芯片筛选新疆维吾尔妇女宫颈癌差异表达基因
引用本文:艾科热木江·台外库 朱明玥 热孜宛古丽·阿卜力米提 宋丹 玛依努尔·尼牙孜 马正海. 基因芯片筛选新疆维吾尔妇女宫颈癌差异表达基因[J]. 中国生物化学与分子生物学报, 2015, 31(6): 645-652
作者姓名:艾科热木江·台外库 朱明玥 热孜宛古丽·阿卜力米提 宋丹 玛依努尔·尼牙孜 马正海
基金项目:国家自然科学基金(No. 31060025)和新疆生物资源基因工程重点实验室开放课题(No. XJDX0201-2013-01)
摘    要:新疆南部维吾尔族聚居区是宫颈癌高发区. 本文旨在利用基因芯片技术筛选与维吾尔族妇女宫颈癌发生相关的基因. 首先,分别提取5例新疆维吾尔妇女宫颈癌和5例子宫肌瘤组织(对照)的mRNA,逆转录成cDNA,并用Cy3-dUTP标记子宫肌瘤组织的cDNA,用Cy5 dUTP标记宫颈癌组织的cDNA,制成芯片杂交探针.为筛选出宫颈癌组织中差异表达的基因,上述标记探针分别与含有20 000条人类基因的Affymetrix基因芯片进行杂交,杂交信号用GeneChip Scanner 3000扫描仪扫描,并用芯片图像分析软件(SAM software)分析扫描结果.筛选出的差异表达基因经GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路分析,确定其在宫颈癌中的作用.基因芯片筛选结果显示,在宫颈癌组织中发现2 758个差异表达基因,其中1 326个上调基因,1 432个下调基因.GO分析和KEGG信号通路分析表明,表达差异在两倍以上的基因涉及168个信号通路,包括细胞粘附分子、细胞周期以及MAPK和mTOR信号通路等.上述结果表明,基因芯片技术筛选出大量与宫颈癌发生相关的基因,其中表达差异显著的基因涉及细胞粘附分子、细胞周期和mTOR等信号通路.

关 键 词:基因芯片  宫颈癌  维吾尔族  差异表达  
收稿时间:2014-12-30

cDNA Microarray Analysis of Cervical Cancer-related Genes in Xinjiang Uyghur Women
Aikeremujiang·Taiwaiku ZHU Ming-Yue Reziwanguli·Abulimiti SONG Dan Mayinuer·Niyazi MA Zheng-Hai. cDNA Microarray Analysis of Cervical Cancer-related Genes in Xinjiang Uyghur Women[J]. Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 2015, 31(6): 645-652
Authors:Aikeremujiang·Taiwaiku ZHU Ming-Yue Reziwanguli·Abulimiti SONG Dan Mayinuer·Niyazi MA Zheng-Hai
Abstract:
Keywords:gene chip  cervical cancer  Uyghur  differential expression  
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