| 癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 周学,杜宜兰,金萍,马飞.癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析[J].遗传,2015,37(9):855-864. |
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| 作者姓名： | 周学 杜宜兰 金萍 马飞 |
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| 作者单位： | 1. 南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院,泰州 225300; 2. 第三军医大学大坪医院健康管理科,重庆 400042; 3. 南京师范大学生命科学学院,南京 210046 |
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| 基金项目： | 南京师范大学泰州学院青年项目(编号：Q201206)资助 |
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| 摘 要： | MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关miRNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关miRNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症miRNA的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。
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| 关 键 词： | MicroRNAs(miRNAs) 癌症 靶基因 宿主基因 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2015-03-22 |
Bioinformatic analysis of cancer-related microRNAs and their target genes |
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| Institution: | 1. School of Chemistry and Biological Engineering, Nanjing Normal University Taizhou College, Taizhou 225300, China; 2. Health Management Department of Daping Hospital, Third Military Medical University, Chongqing 400042,China; 3. College of Life Science, Nanjing Normal University, Nanjing 210046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microRNAs (miRNAs) cancer target gene host gene bioinformatics |
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