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内蒙古西伯利亚杏群体遗传多样性和遗传结构分析
引用本文:包文泉,乌云塔娜,王 淋,赵 罕,杜红岩. 内蒙古西伯利亚杏群体遗传多样性和遗传结构分析[J]. 西北植物学报, 2016, 36(11): 2182-2191
作者姓名:包文泉  乌云塔娜  王 淋  赵 罕  杜红岩
作者单位:(1 国家林业局泡桐研究开发中心,郑州450003;2 中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州450003)
基金项目:国家十二五课题支撑(2013BAD14B02)
摘    要:利用27对SSR分子标记对内蒙古地区13个西伯利亚杏群体的遗传多样性和遗传结构进行分析,评价其遗传多样性水平和分化程度,为内蒙古西伯利亚杏资源的合理保护与利用提供理论依据。结果显示:(1)27对SSR引物共检测到512个等位基因(Na),各位点平均等位基因数(Na)和多态性信息含量(PIC)分别为19和0.84;物种水平上Shannons信息指数(I)和期望杂合度(He)分别为2.25和0.73。(2)群体水平上的等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Shannons信息指数(I)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)分别为6.95、4.48、1.60、0.76和0.56;其中科左后旗群体遗传多样性最丰富,克什克腾旗群体遗传多样性最低。(3)基于F统计量分析的遗传分化系数(Fst)为0.12,基因流(Nm)为1.86;分子方差分析显示内蒙古西伯利亚杏群体大部分遗传变异来自群体内(92%),群体间的遗传变异仅占8%。(4)内蒙古西伯利亚杏群体遗传距离为0.04~0.67,遗传相似度为0.33~0.83;遗传相似度的聚类分析、遗传距离的主坐标分析和遗传结构分析(Structure)均将供试13个群体划分为4组。Mantel检测显示,内蒙古西伯利亚杏群体遗传距离与地理距离呈显著相关关系(r=0.453,P0.01)。研究表明,内蒙古西伯利亚杏资源具有丰富的遗传多样性,这一特性与其群体的大小、悠久的演化历史以及自身生物学特性相关;内蒙古西伯利亚杏群体间存在中等程度的遗传分化,这可能源于自然地理隔离以及近期人类活动引起的生境片段化。

关 键 词:西伯利亚杏;SSR;遗传多样性;遗传结构

Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Siberian Apricot in Inner Mongolia
BAO Wenquan,WUYUN Tan,WANG Lin,ZHAO Han,DU Hongyan. Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Siberian Apricot in Inner Mongolia[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2016, 36(11): 2182-2191
Authors:BAO Wenquan  WUYUN Tan  WANG Lin  ZHAO Han  DU Hongyan
Abstract:
Keywords:Siberian apricot   SSR   genetic diversity   genetic structure
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