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青鱼微卫星标记的开发与特性分析
作者姓名:王丰  张猛  沈玉帮  徐晓雁  王荣泉  李家乐
作者单位:上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室 上海 201306;上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心 上海 201306;上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室 上海 201306;上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心 上海 201306;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 上海 201306;苏州市申航生态科技发展股份有限公司农业部大宗淡水鱼类繁育与健康养殖技术重点实验室 苏州 215221
基金项目:现代农业产业技术体系项目(No. CARS-45-03)
摘    要:青鱼(Mylopharyngodon piceus)是中国最为重要的淡水养殖鱼类。开发青鱼的微卫星标记能为青鱼的遗传多样性分析提供更多工具。本研究使用磁珠富集法,利用生物素探针(CA)10和(GACA)6,富集得到青鱼基因组微卫星片段,进一步通过设计微卫星引物检验其在青鱼原种群体中的有效性和多态性水平。结果显示,所构建文库中849个克隆含有微卫星序列,通过利用PCR技术在吴江原种青鱼36个个体中进行多态性筛选,获得了25个多态性微卫星位点。其平均等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为7.08和3.526,平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.602和0.619,平均多态信息含量(PIC)为0.568。其中,Mp23、Mp27和Mp35这3个位点极显著偏离哈迪-温伯格平衡(P 0.01)。本研究开发的微卫星标记能为青鱼种质资源的评价和保护等研究提供工具。

关 键 词:青鱼  磁珠富集  微卫星  引物开发  多态性
收稿时间:2018-01-23
修稿时间:2018-12-16
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