太湖新银鱼mtDNA COⅡ和Cytb基因的克隆与序列分析

设计了5对特异性引物，扩增、拼接并测定出太湖新银鱼线粒体tRNA^Asp-COⅡ—tRNAL^ys和tRNA^Glu-cytb—tRNA^Thr两段基因序列片段。基因定位和序列分析发现，太湖新银鱼线粒体COⅡ基因全序列长度为691bp。序列AT含量为52．80％，编码230个氨基酸；线粒体Cytb基因序列全长为1141bp，AT含量为48．90％，它编码380个氨基酸。分别位于线粒体COⅡ和Cytb基因两翼的4个tRNA基因（tRNA^Asp、tRNA^Lys、tRNA^Gls和tRNA^Thr）同时被测定出来。将太湖新银鱼与有明银鱼、小齿日本银鱼的同源序列进行比对分析，并基于线粒体COⅡ＋Cytb基因合并数据的核苷酸和氨基酸两种序列形式，以黑斑蛙为外群，对10种鱼类进行分子系统树的构建，结果一致表明：小齿日本银鱼与有明银鱼的亲缘关系近于太湖新银鱼；鲱科与鲑科的亲缘关系近于银鱼科鱼类；此外在本研究硬骨鱼类的4个科中，自鲟科作为原始而古老的类群，是在系统进化的过程中首先分化出来的一支。