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基于地理环境相似度的长江经济带入侵物种虚拟负样本生成方法
引用本文:肖巍峰,左绿荇,杨文涛,李朝奎.基于地理环境相似度的长江经济带入侵物种虚拟负样本生成方法[J].生物多样性,2023,31(1):22094-30.
作者姓名:肖巍峰  左绿荇  杨文涛  李朝奎
作者单位:1.湖南科技大学地球科学与空间信息工程学院, 湖南湘潭 411201
2.湖南省地质灾害监测预警与应急救援工程技术研究中心, 长沙 410004
3.湖南科技大学测绘遥感重点实验室, 湖南湘潭 411201
基金项目:湖南省自然科学基金创新研究群体项目(2020JJ1003);湖南省教育厅科研项目(20C0805)
摘    要:入侵物种空间分布建模的核心数据源来源于物种多样性采样(物种出现点和未出现点),然而,大多数入侵物种标本库只记录物种出现点样本信息,缺乏对未出现点(负样本)位置的记录。因此,生成有效的入侵物种虚拟负样本是建立物种空间分布模型的关键。本文提出了一种基于地理环境相似度的虚拟负样本生成方法。首先利用主成分分析(PCA)方法对地理环境原始变量进行线性相关性建模,基于提取的主成分,采用K-means算法对入侵物种样本进行聚类分析并计算各样本的地理环境相似度。在此基础上,通过建立基于主成分的入侵物种相似性度量与可信度计算框架来识别虚拟负样本。以长江经济带入侵物种一年蓬(Erigeron annuus)数据集为例,分析了整个区域虚拟负样本的可信度。结果表明,与空间随机采样和单类支持向量机采样相比,用本研究提出的方法生成的样本数据建立的logistic回归和支持向量机预测结果更优,验证了该方法的可行性与有效性。基于地理环境相似度的虚拟负样本抽样策略有助于解决由于随机采样而引起的误采样到潜在入侵点的难题,同时负样本的可信度能有助于识别不同等级的入侵物种适应区。

关 键 词:入侵物种  地理环境  可信度  一年蓬  长江经济带
收稿时间:2022-03-01

Generating pseudo-absence samples of invasive species based on the similarity of geographical environment in the Yangtze River Economic Belt
Weifeng Xiao,Lüxing Zuo,Wentao Yang,Chaokui Li.Generating pseudo-absence samples of invasive species based on the similarity of geographical environment in the Yangtze River Economic Belt[J].Biodiversity Science,2023,31(1):22094-30.
Authors:Weifeng Xiao  Lüxing Zuo  Wentao Yang  Chaokui Li
Institution:1. School of Earth Sciences and Spatial Information Engineering, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan, Hunan 411201
2. Hunan Geological Disaster Monitoring, Early Warning and Emergency Rescue Engineering Technology Research Center, Changsha 410004
3. Hunan Provincial Key Laboratory of Geo-Information Engineering in Surveying, Mapping and Remote Sensing, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan, Hunan 411201
Abstract:Aims: Obtaining diversity samples of invasive alien species is crucial for species spatial distribution models. This includes both invasive species presence and absence samples. However, most invasive species data sets lack explicit spatial information for absent species samples. Consequently, generating effective pseudo-absence samples of invasive species is a significant issue for constructing species spatial distribution models. This paper proposed an invasive species pseudo-absence sampling method based on the similarities of geographical environments.
Keywords:invasive species  geographic environment  confidence level  Erigeron annuus  the Yangtze River Economic Belt  
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