| 计算机辅助设计联合斑点杂交筛选铜绿假单胞菌PAO1 motA基因反义寡核苷酸序列 |
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| 引用本文： | 胡建娥,夏云.计算机辅助设计联合斑点杂交筛选铜绿假单胞菌PAO1 motA基因反义寡核苷酸序列[J].生物学杂志,2011,28(1):14-17. |
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| 作者姓名： | 胡建娥 夏云 |
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| 作者单位： | 重庆医科大学附属第一医院检验科,重庆,400016 |
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| 基金项目： | 重庆市自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 为了筛选出能与铜绿假单胞菌PAO1 motA基因的mRNA结合紧密的反义寡核苷酸序列,采用全基因寻靶技术（full length gene targeting,FLGT）,运用计算机软件（Mfold和RNA Structure4.6）模拟铜绿假单胞菌PAO1 motA基因mRNA的二级结构,根据最小自由能原理设计出8条寡核苷酸探针序列;PCR扩增出全长motA基因,克隆motA基因并进行体外转录,同时用地高辛标记mRNA,以斑点杂交方法筛选出与motA基因mRNA结合紧密、杂交信号较强的寡核苷酸序列。斑点杂交结果显示8条寡核苷酸中的4条有较强的杂交信号,从而成功筛选到了能与motA mRNA牢固结合的反义序列,为进一步研究以motA基因为靶的反义技术抑制生物膜形成打下基础。
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| 关 键 词： | 铜绿假单胞菌 斑点杂交 反义寡核苷酸 |
Screening of antisense oligonucleotides targeting the message RNA of PAO1 motA by computer programme prediction and dot blot hybridization |
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| HU Jian-e,XIA Yun.Screening of antisense oligonucleotides targeting the message RNA of PAO1 motA by computer programme prediction and dot blot hybridization[J].Journal of Biology,2011,28(1):14-17. |
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| Authors: | HU Jian-e XIA Yun |
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| Institution: | HU Jian-e,XIA Yun(Department of Clinical Laboratory,The First Affiliated Hospital,Chongqing Medical University,Chongqing 400016,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pseudomonas aeruginosa dot blot hybiridization antisense oligonucleotides |
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