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华南流感病毒NS1基因特性研究
引用本文:张志珍,段炼,李康生.华南流感病毒NS1基因特性研究[J].生物化学与生物物理进展,2004,31(3):237-243.
作者姓名:张志珍  段炼  李康生
作者单位:1. 汕头大学医学院-香港大学医学院联合流感研究中心,汕头大学医学院微生物与免疫学教研室,汕头,515041;山西大学生命科学与技术学院,太原,030006
2. 汕头大学医学院-香港大学医学院联合流感研究中心,汕头大学医学院微生物与免疫学教研室,汕头,515041
基金项目:世界卫生组织资助项目(HQ/01/144185)和广东省高校自然科学研究资助项目(Z02038).
摘    要:为了解H9N2和H5N1亚型流行性感冒病毒株的NS1基因特性,采用RT-PCR方法测定了12株2000~2003年间在华南地区分离的禽流感病毒株的NS1基因核苷酸序列. 测序显示6株H9N2亚型流感病毒NS1基因开放阅读框(ORF)长654 bp,编码217个氨基酸. 6株H5N1亚型毒株NS1基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸. 核苷酸和氨基酸同源性分析表明,同一亚型分离株之间有很高的同源性,而不同亚型的H9N2和H5N1毒株之间存在较大差异. BLAST分析表明,H5N1和H9N2亚型流感病毒分离株的NS1基因分别与近两年从香港特区和华南地区的鸭中分离的毒株A/Duck/Hong Kong/646.3/01 (H5N1)、A/Duck/Shantou/2143/01 (H9N2)有很高的亲缘关系. 该研究结果为进一步进行NS1功能研究奠定了基础.

关 键 词:流行性感冒病毒,NS1基因,序列分析,生物信息学
收稿时间:2003/7/23 0:00:00
修稿时间:2003/9/28 0:00:00

Characterization of NS1 Gene of Influenza A Virus in Southern China
ZHANG Zhi-Zhen,DUAN Lian and LI Kang-Sheng.Characterization of NS1 Gene of Influenza A Virus in Southern China[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2004,31(3):237-243.
Authors:ZHANG Zhi-Zhen  DUAN Lian and LI Kang-Sheng
Institution:Joint Influenza Research Centre (SUMC & HKU), Department of Microbiology and Immunology, Shantou University Medical College, Shantou 515041, China;College of Life Science and Technology, Shanxi University, Taiyuan 030006, China;Joint Influenza Research Centre (SUMC & HKU), Department of Microbiology and Immunology, Shantou University Medical College, Shantou 515041, China;Joint Influenza Research Centre (SUMC & HKU), Department of Microbiology and Immunology, Shantou University Medical College, Shantou 515041, China
Abstract:
Keywords:influenza virus  NS1 gene  sequence analysis  bioinformatics
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