| 鸡miR-21的组织表达谱及其功能预测分析 |
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| 引用本文： | 贾丽娟,闫峰宾,李国喜,徐春林,梅星星,康相涛. 鸡miR-21的组织表达谱及其功能预测分析[J]. 中国生物化学与分子生物学报, 2016, 32(2): 207-215 |
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| 作者姓名： | 贾丽娟 闫峰宾 李国喜 徐春林 梅星星 康相涛 |
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| 作者单位： | 河南农业大学牧医工程学院,河南省家禽种质资源创新工程研究中心, 郑州450002 |
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| 基金项目： | 农业部现代农业产业技术体系(No.CARS-41-K04),国家自然科学基金项目(No. 31572356); 教育部创新团队发展计划(No.IRT1236) |
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| 摘 要： | 已知miR-21在多种生物学过程中发挥重要的调控作用，然而有关鸡miR-21功能的研究尚未见报道。为了解鸡miR 21的潜在生物学功能，采用qRT-PCR检测了固始鸡5个发育阶段、15种组织中miR-21的表达情况。同时，利用Pictar和TargetScan算法预测了miR-21的靶基因并对预测的靶基因进行了Gene Ontology分析和通路分析。结果显示，miR-21的表达具有明显的时序特征，除14胚龄鸡的小脑和腺胃外，胚胎期各组织中miR-21的表达水平均显著低于出壳后对应组织的表达水平；出壳后鸡的下丘脑、大脑、小脑、小肠、肝脏、胸肌和肾脏等组织中miR-21的表达水平随发育进程均显著上调。生物信息学分析显示，预测的miR-21的靶基因在基因表达调控、大分子代谢调控、转录调控、细胞代谢调控、细胞衰老和增殖、呼吸系统发育、骨骼发育、心脏发育和神经系统发育等广泛的生物学过程中显著富集。总之，鸡miR-21为广泛性时序表达miRNA，可能参与鸡出壳后诸多器官发育相关的生物学过程的调控。
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| 关 键 词： | 鸡 miR-21 组织表达谱 功能分析 |
| 收稿时间： | 2015-07-06 |
Tissue Expression Profile and Bioinformatics Analysis of Chicken miR-21 |
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| JIA Li-Juan,YAN Feng-Bin,LI Guo-Xi,XU Chun-Lin,MEI Xing-Xing,KANG Xiang-Tao. Tissue Expression Profile and Bioinformatics Analysis of Chicken miR-21[J]. Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 2016, 32(2): 207-215 |
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| Authors: | JIA Li-Juan YAN Feng-Bin LI Guo-Xi XU Chun-Lin MEI Xing-Xing KANG Xiang-Tao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chicken miR-21 tissue expression profile function analysis |
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