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肇庆星湖湿地放线菌多样性
引用本文:薛冬,赵国振,赵海泉,姚青,朱红惠. 肇庆星湖湿地放线菌多样性[J]. 微生物学报, 2015, 55(5): 616-626
作者姓名:薛冬  赵国振  赵海泉  姚青  朱红惠
作者单位:广东省微生物研究所,省部共建华南应用微生物国家重点实验室,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室,广东广州510070,广东省微生物研究所,省部共建华南应用微生物国家重点实验室,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室,广东广州510070,安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥210095,华南农业大学园艺学院,广东广州510642,广东省微生物研究所,省部共建华南应用微生物国家重点实验室,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室,广东广州510070
基金项目:国家自然科学基金项目(31300011);广东省科技基础条件建设项目(2013B060400043);广东省科学院优秀青年科技人才基金项目(rcjj201301);广东省微生物研究所南粤微生物优秀人才培育基金项目
摘    要:摘要:【目的】了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系。【方法】应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研究,根据DGGE图谱及克隆测序结果对其物种多样性进行分析,并结合样点理化性质对其空间分布特征进行分析。【结果】通过PCR-DGGE指纹图谱发现各样品放线菌物种丰富度(S)、多样性指数(H')和均匀度指数(J')均有所不同。对不同样点放线菌群落相似性进行比较,发现它们的相似性系数存在着一定的关系,相邻样点间相似性较高。对DGGE优势条带进行回收、克隆、测序,显示优势类群主要分布于类诺卡氏菌科( Nocardioidaceae)、链霉菌科(Streptomycetaceae)、小单孢菌科(Micromonosporaceae)、微球菌科(Micrococaceae)、纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)和原小单胞菌科(Promicromonosporaceae)。典型对应分析结果表明,星湖湿地放线菌群落结构变化的主要影响因子为底泥水溶性碳(WSOC)和速效磷(A-P)。【结论】肇庆星湖湿地蕴含着大量的放线菌资源,具有较高的物种多样性,需要进一步挖掘这些新资源。

关 键 词:关键词:聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳,放线菌群落,典型对应分析
收稿时间:2014-10-09
修稿时间:2014-12-10

Actinobacterial diversity in Xinghu Wetland
Dong Xue,Guozhen Zhao,Haiquan Zhao,Qing Yao and Honghui Zhu. Actinobacterial diversity in Xinghu Wetland[J]. Acta microbiologica Sinica, 2015, 55(5): 616-626
Authors:Dong Xue  Guozhen Zhao  Haiquan Zhao  Qing Yao  Honghui Zhu
Abstract:
Keywords:
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