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百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化
引用本文:朱新宇,汪保华,陈曹逸. 百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化[J]. 生物技术, 2012, 22(4): 41-46
作者姓名:朱新宇  汪保华  陈曹逸
作者单位:南通大学生命科学学院,江苏南通,226019
基金项目:江苏省高校自然科学基金项目,国家自然科学基金项目
摘    要:目的:研究百脉根(Lotus japonicus)NIN转录因子和它的旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化。方法:从百脉根基因组中获取完全的NIN旁系同源蛋白质序列,通过生物信息学手段进行系统发育、理化性质、功能位点和蛋白质三级结构同源建模分析。结果:总共获得5个NIN旁系同源蛋白序列,其中2个属于新鉴别的成员,它们分属于两个不同的进化分支;脯氨酸含量在LjNLP3中比次高的LjNLP1增加33%,提示其具有耐旱的功能特征;功能位点分析显示NIN旁系同源蛋白之间存在差异,提示它们可能通过翻译后修饰发生了功能分化;LjNIN蛋白在进化过程中用一段α螺旋替代了LjNLP1的一段β折叠,这一差异可能导致百脉根Nin招募为根瘤感受基因。结论:初步揭示了百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异与功能分化的关系,为进一步的实验研究奠定了基础。

关 键 词:百脉根  根瘤共生  NIN旁系同源蛋白  结构歧异  功能分化

Structural Divergence and Functional Differentiation in NIN Paralogous Proteins from Lotus japonicus
ZHU Xin-yu , WANG Bao-hua , CHEN Cao-yi. Structural Divergence and Functional Differentiation in NIN Paralogous Proteins from Lotus japonicus[J]. Biotechnology, 2012, 22(4): 41-46
Authors:ZHU Xin-yu    WANG Bao-hua    CHEN Cao-yi
Affiliation:(School of Life Sciences,Nantong University,Nantong 226019,China)
Abstract:
Keywords:
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