| 利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法探讨 |
| |
| 引用本文： | 王理上官少方马晓红张霆. 利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法探讨[J]. 现代生物医学进展, 2011, 11(4): 618-623 |
| |
| 作者姓名： | 王理上官少方马晓红张霆 |
| |
| 作者单位： | 首都儿科研究所,北京,100020 |
| |
| 基金项目： | 科技部973项目(2007CB511901); 国家自然科学基金(81000249/H0417); 北京市卫生局青年科学研究资助项目基金(2010-2012) |
| |
| 摘 要： | 目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法。方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点。结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列技术平台能够反映甲基化修饰的真实水平;通过不同条件下PCR扩增效率与甲基化分析的结果,发现扩增效率是制约MassArray分子量阵列技术平台甲基化分析的关键因素,而产物的放置时间和不同的处理没有明显影响甲基化分析。结论:Mas-sArray甲基化分析平台是高效快速检测甲基化修饰的平台,在使用过程中应该根据实际的实验条件,进行合理的质控。
|
| 关 键 词： | MassArray分子量阵列技术平台 甲基化 重亚硫酸盐测序 扩增效率 |
Application of MassArray Platform in Analyzing of Specific MethylationModification |
| |
| WANG Li,SHANGGUAN Shao-fang,MA Xiao-hong,ZHANG Ting. Application of MassArray Platform in Analyzing of Specific MethylationModification[J]. Progress in Modern Biomedicine, 2011, 11(4): 618-623 |
| |
| Authors: | WANG Li SHANGGUAN Shao-fang MA Xiao-hong ZHANG Ting |
| |
| Affiliation: | WANG Li,SHANGGUAN Shao-fang,MA Xiao-hong,ZHANG Ting(Capital Institue of Pediatrics,Beijing,100020,China) |
| |
| Abstract: | Objective:To investigate the methods of specific methylation modification by massarray platform.Methods:Charac-ters of MassArray platform were analyzed by comparing the test efficiency under different amplify and treatment conditions.Results:MassArray platform could detect a real methylation modification of gene by comparing with bisulfite sequencing.By comparing different amplifications,PCR efficiency was a key point for methylation analysis on this platform,while no significant difference was established ... |
| |
| Keywords: | MassArray platform Methylation Bisulfite sequencing PCR efficiency |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《现代生物医学进展》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《现代生物医学进展》下载免费的PDF全文 |
