| 江苏海域几种绿潮藻类rDNA ITS序列分析 |
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| 引用本文： | 陈淑吟,胡传明,陆勤勤,孙中响,许广平,丁亚平.江苏海域几种绿潮藻类rDNA ITS序列分析[J].生物技术通报,2011(3). |
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| 作者姓名： | 陈淑吟 胡传明 陆勤勤 孙中响 许广平 丁亚平 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省海洋水产研究所,南通,226007
2. 江苏省海洋水产研究所,南通,226007;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,苏州,215123 |
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| 基金项目： | 江苏省海洋与渔业局渔业重点项目 |
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| 摘 要： | 于2009年5-7月定点采集了江苏海域绿潮藻类,测定、分析了这些藻类核糖体rDNA ITS序列,并进行分类鉴定。研究结果显示,ITS+5.8S序列片段长度为552-578 bp,其中ITS1序列部分长度为179-182 bp,5.8S序列全长为155-158 bp,ITS2序列全长为180-196 bp,序列的平均GC含量(contents)为61.6%-63.3%,不同ITS序列存在不同的插入/缺失位点。扩增得到27个序列中有7个不同序列,依据NCBI数据库相似性查找、系统进化关系及遗传距离等分析结果,确定有4个种类:浒苔(Ulva prolifeya),缘管浒苔(U.linza),石莼属(Ulva sp.)1种及盘苔属(Blidingia sp.)1种。分析表明,ITS序列可作为石莼科种类鉴定的标记。
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| 关 键 词： | 绿潮藻类 浒苔 石莼 盘苔 ITS序列 分类鉴定 |
Analysis on rDNA ITS Sequence of the Green-tides in the Coast Areas of Jiangsu Province |
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| Chen Shuyin,Hu Chuanming,Lu Qinqin,Sun Zhongxiang,Xu Guangping,Ding Yaping.Analysis on rDNA ITS Sequence of the Green-tides in the Coast Areas of Jiangsu Province[J].Biotechnology Bulletin,2011(3). |
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| Authors: | Chen Shuyin Hu Chuanming Lu Qinqin Sun Zhongxiang Xu Guangping Ding Yaping |
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| Institution: | Chen Shuyin1 Hu Chuanming1 Lu Qinqin1 Sun Zhongxiang1,2 Xu Guangping1 Ding Yaping1(1Marine Fisheries Research Institute of Jiangsu Province,Nantong 226007,2School of Preclinical Medicine and Biological Science,Soochow University Medical Department,Suzhou 215123) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Green-tides Ulva Enterornorpha Blidingia ITS region Phylogenetic relationship |
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