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鸡8个功能基因5'-侧翼区与内含子的 SNP多样性比较
引用本文:饶友生,聂庆华,梁勇,杜颖军,阎文龙,张细权. 鸡8个功能基因5'-侧翼区与内含子的 SNP多样性比较[J]. 生物多样性, 2007, 15(4): 432-436
作者姓名:饶友生  聂庆华  梁勇  杜颖军  阎文龙  张细权
作者单位:1. 华南农业大学动物科学学院,广州,510642;江西教育学院生物技术研究所,南昌,330029
2. 华南农业大学动物科学学院,广州,510642
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:本研究旨在探讨鸡功能基因5'-侧翼区的单核苷酸多态性(SNP)水平.作者以自来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料,扩增了GH、DDBC1、RIKEN、RASGRP3、IGF1、THRSP、VIP及PRL共8个基因的5'-侧翼区DNA序列.扩增序列全长为8,399 bp,SNP的总数为161个,平均每52 bp出现一个SNP.8个功能基因5'-侧翼区核苷酸多样性的θ均值和π均值分别为0.00620±0.00110和0.00559±0.00100.比较检验表明,5'-侧翼区的SNP多样性显著低于内含子区域.5'-侧翼区是基因表达的一个重要调控区域,在分子进化和系统发生过程中承受着比内含子区域更大的选择压,其较低的SNP多样性是适应性较好的表现.Tajima检验与Fu和Li检验表明,与鸡繁殖性状显著关联的VIP基因和PRL基因很可能是人工选择或自然选择的目的基因.

关 键 词:  5'-侧翼区  适应性
修稿时间:2007-04-16

Comparison of SNP diversity between 5'-flanking regions and introns of eight functional genes in chickens
Yousheng Rao,Qinghua Nie,Yong Liang,Yingjun Du,Wenlong Yan,Xiquan Zhang. Comparison of SNP diversity between 5'-flanking regions and introns of eight functional genes in chickens[J]. Biodiversity Science, 2007, 15(4): 432-436
Authors:Yousheng Rao  Qinghua Nie  Yong Liang  Yingjun Du  Wenlong Yan  Xiquan Zhang
Abstract:
Keywords:SNP
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