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鲢EST-SSR标记的开发及其与生长性状关联性分析
引用本文:王丹,邹桂伟,罗相忠. 鲢EST-SSR标记的开发及其与生长性状关联性分析[J]. 水生生物学报, 2020, 44(3): 494-500. DOI: 10.7541/2020.060
作者姓名:王丹  邹桂伟  罗相忠
作者单位:中国水产科学研究院长江水产研究所
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-01);中国水产科学研究院基本科研业务费(2017JBF0201)资助。
摘    要:研究采用Illumina高通量测序技术对鲢(Hypophthalmichthys molitrix)卵组织进行转录组测序分析,筛选多态EST-SSR标记并与生长性状进行关联性分析。研究结果显示:(1)测序组装总Unigene 77129个, SSR共24458个,占所测EST数据的31.7%。鲢包含SSR的EST序列主要有二碱基、三碱基、四碱基和五碱基组成。二碱基中, AC含量最丰富;(2)随机挑选175条EST序列设计SSR引物,筛选出多态EST-SSR标记36个, Blast结果显示有10条已知基因功能;(3)全同胞家系检测结果显示有两个标记与鲢的生长性状相关。SCE26与体长和体重显著相关(P<0.05), SCE65与肥满度显著相关(P<0.05)。研究结果将为鲢的分子标记辅助育种的应用提供基础理论指导。

关 键 词:  EST-SSR  分子标记  家系  生长性状
收稿时间:2019-02-01

DEVELOPMENT OF EST-SSR MARKERS AND ANALYSIS OF GROWTH TRAIT IN SILVER CARP
WANG Dan,ZOU Gui-Wei,LUO Xiang-Zhong. DEVELOPMENT OF EST-SSR MARKERS AND ANALYSIS OF GROWTH TRAIT IN SILVER CARP[J]. Acta Hydrobiologica Sinica, 2020, 44(3): 494-500. DOI: 10.7541/2020.060
Authors:WANG Dan  ZOU Gui-Wei  LUO Xiang-Zhong
Affiliation:(Yangtze River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Wuhan 430223,China)
Abstract:
Keywords:Hypophthalmichthys molitrix  EST-SSR  Molecular marker  Family  Growth traits
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