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| 12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 崔亚茹,张坤山,罗玉萍,李思光.12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2011,30(3). |
| 作者姓名： | 崔亚茹 张坤山 罗玉萍 李思光 |
| 作者单位： | 1. 南昌大学生命科学与食品工程学院,南昌,330031 2. 同济大学医学院,上海,200092 3. 南昌大学生命科学与食品工程学院,南昌,330031;同济大学医学院,上海,200092 |
| 摘 要： | 很多microRNA (miRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇.miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义.miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用.本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇.生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反.序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高.进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力. |
| 关 键 词： | 基因簇 分子进化 |
Bioinformatics Analysis of miR-302 Gene Cluster from 12 Different Species |
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| Cui Yaru,Zhang Kunshan,Luo Yuping,Li Siguang.Bioinformatics Analysis of miR-302 Gene Cluster from 12 Different Species[J].Genomics and Applied Biology,2011,30(3). | |
| Authors: | Cui Yaru Zhang Kunshan Luo Yuping Li Siguang |
| Abstract: | |
| Keywords: | miR-302 |
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