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基于Unscented卡尔曼滤波器的信号转导通路参数与不可观测状态估计
引用本文:刘太元,贾建芳,王宏,岳红. 基于Unscented卡尔曼滤波器的信号转导通路参数与不可观测状态估计[J]. 生物物理学报, 2007, 23(1): 54-66
作者姓名:刘太元  贾建芳  王宏  岳红
作者单位:1. 中国科学院自动化研究所,北京,100080
2. 中国科学院自动化研究所,北京,100080;中北大学自动化系,太原,030051
基金项目:中国科学院引进国外杰出人才基金
摘    要:系统生物学的一个主要目的是建立细胞信号转导通路的数学模型。然而细胞信号转导通路多具有较强非线性、参与生化反应物质多等特点,同时测量数据往往不完备,并且混有来自实验各个阶段的各种噪声,这些都给模型参数估计带来很大困难。该文采用Unscented卡尔曼滤波器估计信号转导通路未知参数与模型不可观测状态。以肿瘤坏死因子诱导的核转录因子κB信号转导通路为例进行了仿真,结果表明,采用该方法可以在噪声干扰下较准确地的估计系统未知参数和不能观测状态。

关 键 词:系统生物学  Unscented卡尔曼滤波器  参数估计  信号转导通路
修稿时间:2006-07-28

Estimate Parameters and Unobservable States of Signalling Pathways with Unscented Kalman Filter
LIU Tai-yuan,JIA Jian-fang,WANG Hong,YUE Hong. Estimate Parameters and Unobservable States of Signalling Pathways with Unscented Kalman Filter[J]. Acta Biophysica Sinica, 2007, 23(1): 54-66
Authors:LIU Tai-yuan  JIA Jian-fang  WANG Hong  YUE Hong
Affiliation:2. Institute of Automation, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China; 2. Department of Automation, North University of China, Taiyuan 030051, China
Abstract:
Keywords:Systems biology  Unscented Kalman filter  Parameter estimation  Signal transduction pathways
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