| 高山被孢霉的基因组及转录组的提取技术研究北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 凌瑞,孙立洁,陈祥松,袁丽霞,吴金勇,姚建铭.高山被孢霉的基因组及转录组的提取技术研究北大核心CSCD[J].生物技术通报,2016(7):34-39. |
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| 作者姓名： | 凌瑞 孙立洁 陈祥松 袁丽霞 吴金勇 姚建铭 |
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| 作者单位： | 1.中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所230031;2.中国科学院湖北产业技术创新与育成中心430072; |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划("863"计划)(2014AA021703)；教育部留学回国人员科研启动基金资助项目(教外司留[2013]693号) |
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| 摘 要： | 基因组和转录组的高通量测序对样品的纯度和含量要求较高,旨在通过研究高山被孢霉在不同培养条件下和采用不同菌丝处理方法对其基因组和转录组质量的影响来确定最佳提取方式。结果表明,PDA培养基培养的菌丝与发酵培养基培养的菌丝经基因组提取后在琼脂糖凝胶电泳中有明显不同的表现,使用发酵培养基培养的菌丝提取的基因组DNA无降解,而以PDA培养基培养的菌丝提取的基因组DNA出现部分降解。在使用国产试剂盒做高山被孢霉转录组RNA提取实验中发现,使用液氮速冻后破碎菌丝并结合使用β-疏基乙醇更易提取到高浓度且无降解的转录组样品。
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| 关 键 词： | 高山被孢霉 基因组 转录组 提取技术 |
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