鲤IGF2b基因5'侧翼区序列克隆及不同鲤该区域GC富集区的甲基化分析 |
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作者姓名: | 张成锋 苏胜彦 朱健 朱文彬 刘珊 董在杰 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 无锡 214081; 南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081; 南京农业大学动物科技学院 南京 210095 |
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基金项目: | 现代农业产业技术体系建设专项资金项目(No.CARS-46),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(No.2009JBFB01),江苏省自然基金项目(No.BK2010146); |
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摘 要: | 鲤(Cyprinus carpio)胰岛素样生长因子2b(insulin-like growth factor 2b,IGF2b)基因为鲤IGF基因家族重要的成员,已有的研究表明5'侧翼区序列对其功能的发挥有重要作用。因此,采用基因组步移法获取5'侧翼区序列,通过亚硫酸盐修饰的方法分析不同品种该区域GC富集区的甲基化状况。本文成功从鲤基因组DNA中获得695 bp的IGF2b 5'侧翼区序列。已获取的IGF2b 5'侧翼区序列经过TFSEARCH分析后发现了多个转录因子结合位点和TATA框,通过BLAST比对发现,鲤IGF2b 5'侧翼区DNA序列与斑马鱼(Danio rerio)IGF2b基因相比,相似性为87%。检测该区域富含GC的序列17个位点,发现建鲤(C.c.var.jian)有2个个体的3个位点出现甲基化,而黄河鲤(C.c.haematopterus)只有1个个体1个位点出现甲基化,这说明2个品种鲤在这个区域出现甲基化修饰的几率低,也验证了这2品种在该基因该区域GC富集区是稳定的。
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关 键 词: | 鲤 IGFb '侧翼区 甲基化 |
收稿时间: | 2011-09-19 |
修稿时间: | 2012-01-04 |
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