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玻璃表面cDNA微阵列的制备与优化
引用本文:谢文章,孙宝全,马清梅,程京. 玻璃表面cDNA微阵列的制备与优化[J]. 生物物理学报, 2002, 18(1): 76-80
作者姓名:谢文章  孙宝全  马清梅  程京
作者单位:1. 清华大学生物科学与技术系,北京,100084;清华大学生物芯片北京国家工程研究中心,北京,100084
2. 清华大学化学系,北京,100084;清华大学生物芯片北京国家工程研究中心,北京,100084
摘    要:对DNA进行荧光标记,确定简单、实用和有效的固定化方法和筛选出合适的杂交条件,是制备DNA阵列的几个关键步骤。在PCR的过程对cDNA进行标记,不同的掺入比例可以得到不同的标记效率,Cye dye-dCTP/dCTP的比例在1:3-1:4较好。将DNA固定到玻璃表面,poly-1-lysine方法是一种不需要对DNA进行修饰的有效方法,其中UV照射的能量以600mJ效果最好;水合(rehydrate)温浴过程的温度以65℃最佳,在固化过程中所用探针的浓度0.2-0.5mg/ml对杂交信号影响不多,也就是芯片表面固定的探讨DNA应选在此范围内,杂交信号与所用的靶DNA的浓度成正相关,且有一定的范围内呈正比例关系。

关 键 词:玻璃表面 cDNA微阵列 制备 优化 DNA芯片 固定化 荧光标记 UV交联 杂交
文章编号:1000-6737(2002)01-0076-05
修稿时间:2001-03-21

THE FABRICATION AND OPTIMIZATION OF cDNA ARRAYS ON THE GLASS SURFACE
XIE Wen-zhang,,SUN Bao-quan,,Ma Qing-mei,,CHENG Jing. THE FABRICATION AND OPTIMIZATION OF cDNA ARRAYS ON THE GLASS SURFACE[J]. Acta Biophysica Sinica, 2002, 18(1): 76-80
Authors:XIE Wen-zhang    SUN Bao-quan    Ma Qing-mei    CHENG Jing
Affiliation:XIE Wen-zhang1,3,SUN Bao-quan2,3,Ma Qing-mei1,3,CHENG Jing1,3
Abstract:
Keywords:DNA chip  UV crosslinking  Fluorescence labeling  Immobilization  Hybridization
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