| 基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析硇洲岛海星共附生微生物多样性 |
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| 引用本文： | 唐慧芳,孙力军,刘颖,陈全毅,房志家.基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析硇洲岛海星共附生微生物多样性[J].微生物学通报,2020,47(6):1675-1684. |
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| 作者姓名： | 唐慧芳 孙力军 刘颖 陈全毅 房志家 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学食品科技学院 广东 湛江 524088 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划项目(2017A030303079，2016A020222014) |
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| 摘 要： | 【背景】海星作为海洋生物中的一类比较高级的棘皮类动物,其体内蕴藏着丰富且具有生物活性的共附生微生物资源。【目的】分析湛江硇洲岛海星中共附生微生物的多样性。【方法】采用IlluminaMiSeq高通量测序技术分别对硇洲岛海星进行共附生细菌16SrRNA基因V3-V4区和共附生真菌18S rRNA基因ITS1-ITS2区的测序,并根据测序结果进行OTU聚类分析、α多样性分析及物种分类分析等。【结果】高通量测序获得细菌和真菌Filtered的数目分别为61992和71196个,OTU数目分别为2384和529个。经物种分类分析,共附生细菌主要为变形菌门(Proteobacteria),其平均相对含量高达77.37%;其次是厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria);其中优势细菌属为嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和乳球菌属(Lactococcus)。共附生真菌主要为子囊菌门(Ascomycota),其相对含量高达92.33%;其次是霉菌门(Fungi)、担子菌门(Basidiomycota)、被孢菌门(Mortierellomycota)和罗兹菌门(Rozellomycota);优势真菌属以毕赤酵母属(Pichia)为主,未经分类的(unclassified)假丝酵母属(Candida)次之;【结论】硇洲岛海星体内蕴藏着丰富的共附生微生物资源,该研究为今后从事海星微生物资源持续开发和挖掘生物活性物质的研究提供一定的参考依据。
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| 关 键 词： | 海星，高通量测序技术，共附生微生物，多样性 |
Analysis of symbiotic microorganism diversity in starfish of Naozhou island based on Illumina MiSeq high-throughput sequencing technology |
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| TANG Hui-Fang,SUN Li-Jun,LIU Ying,CHEN Quan-Yi,FANG Zhi-Jia.Analysis of symbiotic microorganism diversity in starfish of Naozhou island based on Illumina MiSeq high-throughput sequencing technology[J].Microbiology,2020,47(6):1675-1684. |
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| Authors: | TANG Hui-Fang SUN Li-Jun LIU Ying CHEN Quan-Yi FANG Zhi-Jia |
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| Institution: | College of Food Science and Technology, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, guangdong 524088, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Starfish High-throughput sequencing technology Symbiotic microorganisms Diversity |
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