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紫外交联免疫沉淀技术原理及其应用
引用本文:杜亚琼,王琬瑶,高帆,徐旸,时文涛.紫外交联免疫沉淀技术原理及其应用[J].生物化学与生物物理进展,2024,51(1):136-144.
作者姓名:杜亚琼  王琬瑶  高帆  徐旸  时文涛
作者单位:1)天津医科大学基础医学院遗传学系,天津 300070,1)天津医科大学基础医学院遗传学系,天津 300070,1)天津医科大学基础医学院遗传学系,天津 300070,2)南开大学医学院,天津 300071,1)天津医科大学基础医学院遗传学系,天津 300070
基金项目:国家自然科学基金(32170649,81802091) 资助项目。
摘    要:紫外交联免疫沉淀(UV cross-linking immunoprecipitation,CLIP)技术最初建立于2003年。通过紫外交联、免疫沉淀、逆转录及后续的高通量测序等步骤,可在全转录组范围鉴定特定RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)的靶标RNA序列和结合位点。在近20年的应用过程中,该技术被不断改进和完善,可操作性、实验结果的准确性都有所提升,技术的应用范围也有所拓展。本文对CLIP技术的基本原理、实验方法、实际应用进行介绍,着重比较几种主流CLIP技术的异同,并对如何选择具体的技术路线提出建议。

关 键 词:紫外交联免疫沉淀  高通量测序  RNA结合蛋白
收稿时间:2023/3/3 0:00:00
修稿时间:2023/12/2 0:00:00

Principle and Application of Ultraviolet Crosslinking Immunoprecipitation Technology
DU Ya-Qiong,WANG Wan-Yao,GAO Fan,XU Yang and SHI Wen-Tao.Principle and Application of Ultraviolet Crosslinking Immunoprecipitation Technology[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2024,51(1):136-144.
Authors:DU Ya-Qiong  WANG Wan-Yao  GAO Fan  XU Yang and SHI Wen-Tao
Institution:1)Department of Genetics, School of Basic Medical Sciences, Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China,1)Department of Genetics, School of Basic Medical Sciences, Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China,1)Department of Genetics, School of Basic Medical Sciences, Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China,2)School of Medicine, Nankai University, Tianjin 300071, China,1)Department of Genetics, School of Basic Medical Sciences, Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China
Abstract:
Keywords:UV cross-linking immunoprecipitation  high-throughput sequencing  RNA-binding protein
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