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高灵敏焦测序结合生物发光分析仪检测甲型H1N1流感病毒
引用本文:武海萍 刘云龙 童欢 马雪萍 卜莹 周国华. 高灵敏焦测序结合生物发光分析仪检测甲型H1N1流感病毒[J]. 现代生物医学进展, 2014, 14(35): 6818-6822
作者姓名:武海萍 刘云龙 童欢 马雪萍 卜莹 周国华
作者单位:华东医学生物技术研究所;南京大学医学院附属金陵医院药理科
基金项目:国家自然科学基金项目(31300706);江苏省科技支撑计划-社会发展项目(BE2011607);第54批中国博士后科学基金面上资助项目(2013M542575)
摘    要:目的:建立基于核酸序列分析的快速、准确、低成本的甲型H1N1流感病毒检测方法。方法:通过优化焦测序反应体系中ATP硫酸化酶和荧光素酶的浓度,建立高灵敏的焦测序反应体系;将该体系应用于低成本、小型化的便携式生物发光分析仪,焦测序分析流感病毒M、NP、HA基因片段的核酸序列。结果:优化后的焦测序反应体系可检测低至10 fmol的DNA样本,检测灵敏度较传统焦测序提高了10倍以上。对两例样本进行检测,根据所测得的M、NP、HA基因特异性片段序列,可以确认其均为甲型H1N1感染;另外,对M2蛋白阻断剂耐药性标志位点(S31N突变)的测定结果显示该病毒存在S31N突变,为M2蛋白阻断剂耐药型。结论:高灵敏焦测序体系结合便携式生物发光分析仪成功实现了对甲型H1N1流感病毒快速、准确的低成本检测。

关 键 词:高灵敏焦测序  甲型H1N1流感病毒  耐药性突变  便携式生物发光分析仪

Detection of Influenza A (H1 N1 ) Virus Using Highly SensitivePyrosequencing Combining Bioluminescence Analyzer
WU Hai-ping,LIU Yun-long,TONG Huan,MA XUE-ping,BO Ying,ZHOU Guo-hua. Detection of Influenza A (H1 N1 ) Virus Using Highly SensitivePyrosequencing Combining Bioluminescence Analyzer[J]. Progress in Modern Biomedicine, 2014, 14(35): 6818-6822
Authors:WU Hai-ping  LIU Yun-long  TONG Huan  MA XUE-ping  BO Ying  ZHOU Guo-hua
Affiliation:WU Hai-ping;LIU Yun-long;TONG Huan;MA Xue-ping;BU Ying;ZHOU Guo-hua;Huadong Research Institute for Medicine and Biotechnics;Department of Pharmacology, Jinling Hospital, Medical School of Nanjing University;
Abstract:
Keywords:Highly sensitive pyrosequencing   Influenza A (H1N1 ) virus   Drug resistance mutations   Portable bioluminescenceanalyzer
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