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乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析
引用本文:李滚,张涛,杨鑫荣,卢香香.乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析[J].生物信息学,2019,17(2):86-94.
作者姓名:李滚  张涛  杨鑫荣  卢香香
作者单位:西安工业大学电子信息工程学院生物医学工程系
基金项目:陕西省教育厅专项科学研究计划(No.18JK0377).
摘    要:乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关,它存在逆转录过程并且具有极强的潜伏性。本论文应用生物信息学分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在线分析软件预测乙肝病毒S蛋白的理化性质和亲疏水性、跨膜区域、信号肽特征、磷酸化位点、二级结构以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。结果显示了乙肝病毒S蛋白由226个氨基酸组成,理论等电点是8.21,为不稳定蛋白,总平均亲水性为0.649,是疏水蛋白质,并且该蛋白存在信号肽,有4个跨膜区,有30个潜在的磷酸化位点,主要二级结构为α螺旋和无规则卷曲,同时,结合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、线性表位、β转角、柔性、抗原性的预测结果,可以找到潜在的抗原表位区域,为乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的参考依据,有利于进一步对乙型肝炎S蛋白的抗原性进行研究。

关 键 词:HBV病毒  S蛋白  抗原表位  生物信息学
收稿时间:2018/10/29 0:00:00
修稿时间:2018/12/19 0:00:00

Sequence characterization of S protein in hepatitis B virus
LI Gun,ZHANG Tao,YANG Xinrong and LU Xiangxiang.Sequence characterization of S protein in hepatitis B virus[J].China Journal of Bioinformation,2019,17(2):86-94.
Authors:LI Gun  ZHANG Tao  YANG Xinrong and LU Xiangxiang
Abstract:
Keywords:Hepatitis B virus  S protein  Epitope  Bioinformatics
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