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家蝇小热休克蛋白(sHsp20.6)的生物信息学分析
引用本文:李显航,刘红美. 家蝇小热休克蛋白(sHsp20.6)的生物信息学分析[J]. 生物信息学, 2013, 11(1): 65-71
作者姓名:李显航  刘红美
作者单位:李显航 (贵阳医学院医学生物技术教研室,贵阳,550004); 刘红美 (贵阳医学院医学生物技术教研室,贵阳,550004);
基金项目:贵州省科技厅联合基金(黔科合[2010]3141,贵州省高层次人才科研条件特助经费(项目编号:867)
摘    要:研究家蝇小热休克蛋白sHsp20.6的生物学功能。方法应用生物信息学的方法和工具对家蝇sHsp20.6的理化性质、疏水性、跨膜区和信号肽、膜体分析、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模进行分析。结果表明:家蝇sHsp20.6是一个亲水蛋白,分子量为20.64kD,等电点为5.66,不具有跨膜区和信号肽,包含有一个HSP20的结构域,主要构成原件为α螺旋和无规则卷曲,三维结构预测显示该蛋白为棒状结构,C端结构域具有7个片层结构。聚类分析显示,家蝇sHsp20.6蛋白与昆虫中的直系同源小热休克蛋白(orthologoussmallheatshockprotein)聚为一类。

关 键 词:家蝇  小热休克蛋白  生物信息学
收稿时间:2012-05-16
修稿时间:2012-06-20

Bioinformatic analysis of small heat shock protein (sHsp20.6) in Musca Domestica L.
LI Xian-hang and LIU Hong-mei. Bioinformatic analysis of small heat shock protein (sHsp20.6) in Musca Domestica L.[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2013, 11(1): 65-71
Authors:LI Xian-hang and LIU Hong-mei
Affiliation:* (Department of Medical Biotechnology,Guiyang Medical College,Guiyang 550004,China)
Abstract:
Keywords:Musca domestica L.  Small Heat Shock Protein  Bioinformatics
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