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汉坦病毒的基因分型及其序列分析
引用本文:孙永涛 白雪帆. 汉坦病毒的基因分型及其序列分析[J]. Virologica Sinica, 1996, 11(4): 319-324
作者姓名:孙永涛 白雪帆
作者单位:西安第四军医大学唐都医院传染科
摘    要:为了探讨从核苷酸水平耐汉坦病毒进行分型,设计两对型特异性引物,采用反转录和聚合酶链式反应(RT-PCR),对亚太地区18株汉坦病毒进行了扩增鉴定,并对其中7株汉坦病毒的PCR产物进行了测序分析。PCR的分型结果表明,Ⅰ型引物只能扩增血清Ⅰ型病毒的cDNA;Ⅱ型引物也只能扩增血清Ⅱ型病毒,其间无交叉反应。采用巢式PCR和限制性内切酶验证了PCR产物的特异性。序列分析结果表明,R36M片段G1区的核苷酸序列与血清Ⅰ型病毒代表株76-118的同源性为78.4%,而与血清Ⅱ型病毒R22的同源性为68.1%;R36与汉坦病毒序列同源性的成对比较结果也表明,R36与血清Ⅰ型病毒的同源性均高于血清Ⅱ型病毒;Leakey虽然能被Ⅱ型引物扩增,但其序列与血清Ⅱ型病毒R22的同源性仅为44.9%,故不属于血清Ⅱ型病毒。上述研究结果表明,反转录聚合酶链反应能对多数汉坦病毒准确分型,但最终结果尚有赖于序列分析。

关 键 词:肾综合征出血热,汉坦病毒,基因分型

Genomic Typing and Sequence Analysis of Hantavirus
Sun Yongtao,Bai Xuefan,Yang Weisong,Huang Changxing,Zhou Yongxing. Genomic Typing and Sequence Analysis of Hantavirus[J]. 中国病毒学(英文版), 1996, 11(4): 319-324
Authors:Sun Yongtao  Bai Xuefan  Yang Weisong  Huang Changxing  Zhou Yongxing
Abstract:
Keywords:Hemorrhagic fever with renal syndrome(HFRS)  Hantavirus  Genomic typing  
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