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一种新的泛素化-铁死亡相关基因特征用于肝细胞癌患者预后分析
作者姓名:张豪  郭泽皓  曹骏  莫之婧  金荣仲
作者单位:1. 桂林医学院智能医学与生物技术学院;2. 广西高校生物化学与分子生物学重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目(32060159)资助;
摘    要:本研究通过筛选泛素化-铁死亡相关基因构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)预后模型,并探究泛素化-铁死亡相关基因对HCC预后的影响。使用R包DESeq2对TCGA-LIHC数据集进行差异分析,获取HCC差异表达基因(HCC_DEGs)。将HCC_DEGs、泛素化相关基因(ubiquitination related genes, URGs)和铁死亡差异表达基因(ferroptosis_differentially expressed genes, FERR_EDGs)取交集获得泛素化和铁死亡相关基因(UBFE_EDGs),将UBFE_EDGs依次进行LASSO回归分析、单因素Cox回归分析和多因素Cox回归分析以筛选出最佳独立预后基因用于构建HCC预后模型(ubiquitination and ferroptosis-related prognostic model, UBFE)。由生存曲线、 ROC曲线和校正曲线评估UBFE的预测准确性。单因素Cox回归分析、多因素Cox回归分析评估UBFE风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并构建列线图模型。...

关 键 词:肝细胞癌  铁死亡  泛素化  预后
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