通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白 |
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引用本文: | 沈敏,徐道博,彭美玲,卢嘉怡,李一博,苏元,彭雪艳,刘云峰.通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白[J].基因组学与应用生物学,2024(3):387-399. |
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作者姓名: | 沈敏 徐道博 彭美玲 卢嘉怡 李一博 苏元 彭雪艳 刘云峰 |
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作者单位: | 广西大学生命科学与技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31970603);;广西自然科学基金(2019GXNSFDA185001); |
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摘 要: | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)DSP1(defective in snRNA processing 1)蛋白是DSP复合物的主要成员,其参与snRNA转录和剪切成熟,并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质,并预测了DSP1蛋白的二级结构和高级结构。在全长DSP1蛋白无法在细菌表达系统中诱导的情况下,通过无缝克隆技术成功构建包含DSP1蛋白N端(DSP1-N)的重组蛋白表达载体,并且成功纯化了GST-DSP1-N重组蛋白,进一步制备了DSP1的特异性多克隆抗体。通过免疫共沉淀和液相色谱串联技术,共鉴定出45个潜在的与DSP1互作的蛋白,后续的功能聚类分析结果暗示DSP1蛋白可能通过蛋白质代谢、核酸结合活性等方面发挥生物学功能。本研究可为进一步揭示DSP1蛋白在植物中的功能提供研究目标和方向。
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关 键 词: | DSP1蛋白 重组蛋白 免疫共沉淀 液相色谱-串联质谱法 互作蛋白 |
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