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通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白
引用本文:沈敏,徐道博,彭美玲,卢嘉怡,李一博,苏元,彭雪艳,刘云峰.通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白[J].基因组学与应用生物学,2024(3):387-399.
作者姓名:沈敏  徐道博  彭美玲  卢嘉怡  李一博  苏元  彭雪艳  刘云峰
作者单位:广西大学生命科学与技术学院
基金项目:国家自然科学基金项目(31970603);;广西自然科学基金(2019GXNSFDA185001);
摘    要:拟南芥(Arabidopsis thaliana)DSP1(defective in snRNA processing 1)蛋白是DSP复合物的主要成员,其参与snRNA转录和剪切成熟,并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质,并预测了DSP1蛋白的二级结构和高级结构。在全长DSP1蛋白无法在细菌表达系统中诱导的情况下,通过无缝克隆技术成功构建包含DSP1蛋白N端(DSP1-N)的重组蛋白表达载体,并且成功纯化了GST-DSP1-N重组蛋白,进一步制备了DSP1的特异性多克隆抗体。通过免疫共沉淀和液相色谱串联技术,共鉴定出45个潜在的与DSP1互作的蛋白,后续的功能聚类分析结果暗示DSP1蛋白可能通过蛋白质代谢、核酸结合活性等方面发挥生物学功能。本研究可为进一步揭示DSP1蛋白在植物中的功能提供研究目标和方向。

关 键 词:DSP1蛋白  重组蛋白  免疫共沉淀  液相色谱-串联质谱法  互作蛋白
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