黑须污蝇不同发育阶段转录组及嗅觉相关基因分析 |
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引用本文: | 王超,包花尔,乌云高娃,崔阿拉腾乌拉,巴音吉日嘎拉,额尔敦木图.黑须污蝇不同发育阶段转录组及嗅觉相关基因分析[J].昆虫学报,2019,62(6):685-693. |
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作者姓名: | 王超 包花尔 乌云高娃 崔阿拉腾乌拉 巴音吉日嘎拉 额尔敦木图 |
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作者单位: | (1. 内蒙古农业大学兽医学院, 农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室, 呼和浩特 010018; 2. 内蒙古师范大学生命科学与技术学院, 呼和浩特 010022; 3. 阿拉善左旗巴润别立动物卫生监督站, 内蒙古巴彦浩特 750308) |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31360591) |
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摘 要: | 【目的】建立黑须污蝇Wohlfahrtia magnifica转录组数据库,挖掘黑须污蝇基因数据,为更深入地研究双峰驼阴道蝇蛆病提供理论依据。【方法】采用高通量测序平台Illumina HiseqTM4000对黑须污蝇幼虫、蛹和成虫进行转录组测序,并进行生物信息学分析。利用黑须污蝇幼虫、蛹和成虫转录组数据,通过基因差异表达分析以及GO功能显著性富集分析的方法筛选出嗅觉相关基因,并通过荧光定量PCR技术对黑须污蝇幼虫、蛹和成虫中OBP99b,OBP56a和OBP99a 3个嗅觉相关基因表达水平进行验证。【结果】结果显示,每个黑须污蝇样本的转录组数据量在4.96 Gb以上,G+C含量在35.35%以上,Q20含量在97%以上。与NCBInr, GO, KEGG, Pfam, Swiss-Prot和eggNOG数据库进行对比,共注释到73 303条unigenes。其中eggNOG数据库注释到的unigenes最多,为35 066条,分布在23个蛋白功能中,其中的翻译修饰、蛋白质周转的unigenes所占比例较大;GO数据库注释到的unigenes数为29 193条,功能包括分子功能、细胞组分、生物学过程三大类50个分支,其中参与生物学过程和氧化还原过程的unigenes比例较大;KEGG数据库注释到的unigenes数为15 068条,其中参与信号转导过程的unigenes比例较大。上述数据表明该转录组测序结果较好,为后续研究奠定了基础。依据黑须污蝇幼虫、蛹、成虫转录组数据筛选到30个嗅觉相关基因,其中包含9个气味结合蛋白(OBP)基因,进一步基因注释发现OBP99b,OBP56a和OBP99a基因在黑须污蝇不同发育阶段表达差异显著(|log2FC|>1,P<0.05),这在荧光定量PCR分析结果中得到了验证。【结论】本研究获得了黑须污蝇幼虫、蛹和成虫转录组数据,筛选出黑须污蝇各发育阶段嗅觉相关基因,并验证了OBP99b,OBP56a和OBP99a基因在黑须污蝇幼虫、蛹和成虫3个发育阶段差异表达,为防治双峰驼阴道蝇蛆病提供了新思路。
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关 键 词: | 黑须污蝇 转录组 高通量测序 生物信息学分析 荧光定量PCR |
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