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| 水稻瘤矮病毒基因组S9片段的基因结构特征 | |
| 引用本文： | 范国成,吴祖建,黄明华,练君,梁栋,林奇英,谢联辉.水稻瘤矮病毒基因组S9片段的基因结构特征[J].中国病毒学,2005,20(5):539-542. |
| 作者姓名： | 范国成 吴祖建 黄明华 练君 梁栋 林奇英 谢联辉 |
| 作者单位： | 1. 福建农林大学植物病毒研究所,福建,福州,350002;福建省农业科学院果树研究所,福建,福州,350013 2. 福建农林大学植物病毒研究所,福建,福州,350002 3. 广东省信宜市农作物病虫测报站,广东,信宜,525300 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(39900091) |
| 摘 要： | 应用RT-PCR技术克隆了水稻瘤矮病毒(RGDV)中国广东信宜分离物(RGDV-C)的基因组S9片段,测定了全序列并进行了生物信息学分析.结果表明,RGDV-C S9片段全长共有1202bp(登录号AY556483),含有一个长的开放阅读框,这一开放阅读框编码一个由323个氨基酸残基组成的多肽,推测分子量约35.6kDa,与泰国分离物(RGDV-T)的全序列相比,它们的核苷酸长度相等,核苷酸同源性为98.1%,氨基酸同源性为98.5%.RGDV S9片段编码的Pns9蛋白在植物呼肠孤病毒属内未发现同源蛋白,其功能尚待确定.利用NCBI的BLAST查找与比较,发现Pns9与伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)ATP依赖的Clp蛋白水解酶组分ATP-dependent Clp protease proteolytic component(clpP-1)]有21.8%的氨基酸序列同源性. |
| 关 键 词： | 水稻瘤矮病毒 基因组S9片段 序列 |
| 文章编号： | 1003-5125(2005)05-0539-04 |
| 修稿时间： | 2005年3月14日 |
Molecular characterization of the genome segment S9 of Rice gall dwarf virus |
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| FAN Guo-cheng,WU Zu-jian,HUANG Ming-hua,LIAN Jun,LIANG Dong,LIN Qi-ying,XIE Lian-hui.Molecular characterization of the genome segment S9 of Rice gall dwarf virus[J].Virologica Sinica,2005,20(5):539-542. | |
| Authors: | FAN Guo-cheng WU Zu-jian HUANG Ming-hua LIAN Jun LIANG Dong LIN Qi-ying XIE Lian-hui |
| Abstract: | |
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