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口腔癌相关蛋白质的细致功能预测
引用本文:王敏,王靖,肖会,龚雪,郭政. 口腔癌相关蛋白质的细致功能预测[J]. 生物信息学, 2009, 7(3): 223-226
作者姓名:王敏  王靖  肖会  龚雪  郭政
作者单位:1. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,成都,610054
2. 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,哈尔滨,150086
3. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,成都,610054;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,哈尔滨,150086
摘    要:口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是人类最常见的恶性肿瘤之一。本文结合Gene Ontology,功能先验知识,通过构建功能特异的蛋白质互相作用子网来预测口腔癌相关蛋白质的功能。我们以很高的精确率为已知部分功能的口腔癌相关蛋白质预测了更为精细的功能,这对于指导实验研究口腔癌的分子机制具有重要的价值。

关 键 词:口腔癌  蛋白质功能  蛋白质互作网络  Gene  Ontology

Finding finer functions for proteins related to oral squamous cell carcinoma
WANG Min,WANG Jing,XIAO Hui,GONG Xue,GUO Zheng. Finding finer functions for proteins related to oral squamous cell carcinoma[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2009, 7(3): 223-226
Authors:WANG Min  WANG Jing  XIAO Hui  GONG Xue  GUO Zheng
Affiliation:1. Bioinformaties Centre, School of Life Science, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu 610054, China ; 2. School of Bioinformaties Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin 150086, China )
Abstract:OSCC(oral squamous cell carcinoma)is one of the commonest hunman malignant tumours. Based on protein interaction sub- networks defined in function - specific subspaces by using Gene Ontology, we suggest an approach to find the finer functions of OSCC - associated proteins. The proposed approach is able to precisely find finer functions for these OSCC - associated proteins. The predicted finer functions are highly valuable for guiding the follow- up wet - lab research on the molecular mechanism of OSCC.
Keywords:Gene Ontology
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