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| 基于ChIP-Seq进行肿瘤/睾丸抗原XAGE-1b的DNA结合位点鉴定 | |
| 作者姓名： | 高学鹏 朱嗣博 赵瑞华 朱乃硕 |
| 作者单位： | 复旦大学生命科学学院;遗传工程国家重点实验室;生物医学研究院; |
| 基金项目： | 国家科技重大专项资助项目(No.2012ZX10002006-002-003);国家高技术研究发展计划生物和医药技术领域课题资助项目(No.2011AA02A114);上海市自然科学基金资助项目(No.13431900602);国家自然科学基金资助项目(No.30571650,No.31370927)~~ |
| 摘 要： | XAGE-1b(X antigen family member 1B)属于XAGE亚家族,是一种肿瘤-睾丸抗原(cancer/testis antigen,CTA),表达于正常人睾丸组织和多种类型的肿瘤细胞中.本实验室前期研究发现,该基因在涎腺腺样囊性癌高转移细胞系中呈高表达.为了进一步研究XAGE-1b下游调控基因,本实验采用ChIP-Seq技术筛查XAGE-1b蛋白质可能存在的DNA结合片段.结果发现,XAGE-1b下游调控基因富集于细胞分裂(cell division,P-Value=7.95e-04)、细胞周期调控(cell cycle,P-Value=5.532e-03)、及癌症相关基因(GESA/MSigDB module_11,P-Value=2.010e-06)中.同时发现,XAGE-1b下游调控多个基因的表达产物(NCBI/interactions 22827,P-Value=4.678e-06)能与原癌基因c-Myc的启动子抑制蛋白PUF60发生蛋白质相互作用,并通过qPCR进行了验证.这些研究对阐明XAGE-1b在肿瘤细胞的增殖和转移中的作用有重要意义. |
| 关 键 词： | 肿瘤睾丸抗原 XAGE-b 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq) PUF c-Myc |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |