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家蚕BmAKR基因家族的鉴定及在蚕卵中的表达分析
引用本文:龚竞,张伟,王清浪,朱子健,庞家欣,侯勇. 家蚕BmAKR基因家族的鉴定及在蚕卵中的表达分析[J]. 生物工程学报, 2023, 39(12): 4982-4995
作者姓名:龚竞  张伟  王清浪  朱子健  庞家欣  侯勇
作者单位:西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室, 重庆 400715;西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院, 重庆 400715;西南大学 资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室, 重庆 400715;西南大学 前沿交叉学科研究院生物学研究中心, 重庆 400715
基金项目:国家重点研发计划(2022YFD1201600);国家自然科学基金(31872429);重庆市自然科学基金(cstc2021jcyj-msxmX1166)
摘    要:醛酮还原酶超家族(aldo-keto reductase super family,AKRs)具有广泛的底物特异性,目前尚未见对昆虫AKR基因家族成员的系统鉴定报道。本研究采用生物信息学手段,预测了家蚕(Bombyx mori) AKR基因的系统进化、理化性质、染色体定位、保守基序和基因结构,通过转录组数据和实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real time polymerase chain reaction,q RT-PCR)分析了不同组织时期及不同发育状态蚕卵中Bm AKR基因的表达水平,并采用Western blotting检测了蚕卵中该蛋白的表达量。本研究共鉴定出11个Bm AKR基因,分布在4条不同的染色体上,都具有AKR家族特有的(α/β) 8桶保守结构,理化特征较为相似;系统进化分析显示,其可分为2个家族(AKR1和AKR2)。转录组数据分析显示,家族成员基因在不同组织时期中的表达差异较大。进一步分析发现,一部分Bm AKR基因在非滞育卵的表达量显著高于滞育卵;但Bm AKR1-1在滞育卵中的表达量却显著高于非滞育卵。蛋白水平的检测发现Bm AKR1...

关 键 词:家蚕  BmAKR基因家族  滞育卵  表达分析  系统进化
收稿时间:2023-02-14

Genome-wide identification of the BmAKR gene family in the silkworm (Bombyx mori) and their expression analysis in diapause eggs and nondiapause eggs
GONG Jing,ZHANG Wei,WANG Qinglang,ZHU Zijian,PANG Jiaxin,HOU Yong. Genome-wide identification of the BmAKR gene family in the silkworm (Bombyx mori) and their expression analysis in diapause eggs and nondiapause eggs[J]. Chinese journal of biotechnology, 2023, 39(12): 4982-4995
Authors:GONG Jing  ZHANG Wei  WANG Qinglang  ZHU Zijian  PANG Jiaxin  HOU Yong
Affiliation:State Key Laboratory of Resource Insects, Southwest University, Chongqing 400715, China;College of Sericulture, Textile and Biomass Sciences, Southwest University, Chongqing 400715, China;State Key Laboratory of Resource Insects, Southwest University, Chongqing 400715, China;Biological Science Research Center, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Southwest University, Chongqing 400715, China
Abstract:
Keywords:Bombyx mori  BmAKR gene family  diapause eggs  expression analysis  phylogenetic evolution
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