柳树β微管蛋白基因家族的克隆和序列分析 |
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引用本文: | 睢金凯,饶国栋,张建国.柳树β微管蛋白基因家族的克隆和序列分析[J].西北植物学报,2016,36(5):902-909. |
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作者姓名: | 睢金凯 饶国栋 张建国 |
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作者单位: | (1 国家林业局林木培育重点实验室,中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091;2 南京林业大学南方现代林业协同创新中心,南京 210037) |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年项目(31400569) |
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摘 要: | 该研究克隆鉴定了旱柳和龙爪柳β微管蛋白基因,并对其进行了序列相似性、系统发育、染色体定位以及表达模式的分析。结果显示,2种柳树β微管蛋白基因家族各有20个成员,家族内部成员间核酸和氨基酸序列相似性分别在74.0%和86.6%以上,种间同源蛋白氨基酸序列相似性在85.8%以上,柳树与其它植物β微管蛋白间的氨基酸序列相似性在81.5%以上。系统发育分析显示,柳树β微管蛋白家族被分为4个亚组,结合杨树β微管蛋白基因染色体定位,推测柳树β微管蛋白基因家族经历了杨柳科全基因组重复事件和串联重复事件,而柳树TUB11和TUB12可能来源于区段重复或者转座。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的组织特异性,并且部分重复基因对在所检测组织中表达差异较大。柳树β微管蛋白基因家族成员序列的高度相似性、成员数量的进化扩张、以及表达模式的多样性可能赋予了细胞分裂与生长更高的灵活性,这对多年生木本植物的生长发育习性意义重大。
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关 键 词: | 柳树 β微管蛋白 系统发育 序列相似性 表达模式 |
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