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基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因
引用本文:于静洋,李倩倩,焦杨,李秋莉.基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因[J].生物工程学报,2017,33(1):111-121.
作者姓名:于静洋  李倩倩  焦杨  李秋莉
作者单位:辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081,辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081,辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081,辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081
基金项目:国家自然科学基金 (No. 31340052),辽宁省教育厅科技研究项目 (No. L201683655) 资助。
摘    要:研究已表明植物特有的一些NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)转录因子可提高植物抗逆性,利用基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥与野生型拟南芥间差异表达基因,能够为研究转基因拟南芥非生物胁迫抗性相关基因提供依据。结果显示,在转SlNAC1基因拟南芥43 604个基因中有3 046个差异表达2倍以上的基因。对差异表达5倍以上基因经过GO富集度统计学分析表明,细胞组分相关基因占33.05%;分子功能相关基因占33.95%;生物学过程相关基因占33.00%。对差异表达2倍以上基因进行KEGG信号通路分析,结果表明有2 431个基因涉及到88个不同的信号通路。通过筛选获得转基因拟南芥非生物胁迫抗性相关候选基因,为后续研究NAC转录因子的下游基因及其调控网络的构建提供方向和理论支撑。

关 键 词:差异表达,转基因,非生物胁迫抗性,转录因子,GO分析,KEGG
收稿时间:2016/6/14 0:00:00

Gene chip analysis of differentially expressed genes in transgenic SlNAC1 Arabidopsis
Jingyang Yu,Qianqian Li,Yang Jiao and Qiuli Li.Gene chip analysis of differentially expressed genes in transgenic SlNAC1 Arabidopsis[J].Chinese Journal of Biotechnology,2017,33(1):111-121.
Authors:Jingyang Yu  Qianqian Li  Yang Jiao and Qiuli Li
Institution:College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, Liaoning, China,College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, Liaoning, China,College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, Liaoning, China and College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, Liaoning, China
Abstract:
Keywords:
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